问题 旧转录组数据是否还能重新分析一遍？

老师，你好！我们实验室有一批很早之前的转录组数据，那时公司提供的分析内容很少，而且用的基因组版本也比较久，我想重新分析一遍可以吗？

问题 用于动物基因家族成员的顺式作用元件分析的数据库

请教老师，是否有用于动物基因家族成员的顺式作用元件分析的数据库？PLANTCARE是植物的

问题 老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

上面是你们给的下载地址运行出来的提示 这个是我自己数据运行的5.7版本提示

问题 不同胁迫处理以及不同类型的RNAseq数据denovo组装

老师您好：     我想综合实验室的RNAseq数据做分析，之前不同时间处理的样品，call表达量用的基因ID不一样。现在想统一下。 由于不同批次测序类型也不一样，有双端测序也有单端测序结果。样品是各种用胁迫处理，比如说...

文章 提取R中字符向量中的所有最大长度值，提取向量最大值

...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...

问题 GEO里面同一个文章名字，同一个作者，GPL一致，GSE不一样，发表年份一年，那么如果要进行数据分析的话，这个都需要拿出来分析么？还是只分析样本数据最多的哪个

问题 单细胞测序数据rds文件替代某列信息

老师您好!我想问下单细胞测序数据如何将rds文件和pbmc.metadata.tsv文件中的某列信息给替换成其它信息？麻烦老师解答，谢谢

文章 TCGA-构建ceRNA网络的软件GDCRNATools

...有分析内容。 该软件的主要功能可以概括如下：    1. 数据下载         1.1   支持转录组数据和miRNA数据的下载和数据合并         1.2  支持临床数据的下载，但是数据的合并，该软件还存在bug  2.  数据分析      ...

问题 TCGA临床数据下载报错 “start tag expected ,'

在下载完临床数据之后 执行clinical <- GDCprepare_clinic(query, clinical.info = "patient",directory = DataDirectory) 出现上述错误，我尝试修改文件目录，也不行

文章 在线绘制聚类热图（heatmapper）

...支持多种格式图片的下载。 绘图之前，需要准备相应的数据文件。在这里小编使用的是基因的表达量数据来绘制聚类热图。 数据文件准备好之后，需要把该文件上传，上传完成之后需要稍等片刻（在线工具有延时），右侧图...

文章 部分基础绘图函数隐藏坐标轴（并重绘）

...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...

文章 亚型划分比较波浪图（桑基图）绘制

...它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，所有主支宽度的总和应与所有分出去的分支宽度的总和相等，保持能量的平衡，非常适用于用户流量等数据的可视化分析。在一些高分文章中我们有时会...

问题 转录组基因时间聚类-Mfuzz的示例数据课程里面没有

转录组基因时间聚类-Mfuzz的示例数据（gene_fpkm.txt）课程里面没有，老师能否给我发一份谢谢！

问题 有多个时期的转录组数据，如何进行基因注释

老师好，想问下如果有多个不同时期的转录组数据，在03.Braker.sh中，是分别进行比对获得bam文件，然后在braker.pl中输入多个bam文件吗？是的话，gff3文件可以是各个文件cat一起吗？还是有其他操作？

文章 IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路（GWAS Catalog）

...用到两个表型的情况。cFDR通过整合两个GWAS Meta汇总统计数据，以与第二个表型的关联程度为条件确定SNPs变异位点数据集，鉴定与第一个表型关联的位点。待检测的关联表型称为“主要表型”，第二个表型作为“条件表型”。Andr...