老师您好！我在进行16S微生物组数据双端合并的时候，执行这项代码： qiime vsearch merge-pairs \ --i-demultiplexed-seqs primer-trimmed-demux.qza \ --p-threads 7 \ --o-merged-sequences demux-joined.qza后，查看合并结果，发现合并前后数...
就是这样的图，我看分析流程根据方法下载了转录组数据，有作图的教程，没有说怎么结合基因家族分析，数据怎么处理。
我不知道数据有没有下载完，但是下载的列表里，只有clinical. tsv，没有expression.tsv。我自己在TCGA里下载的数据有4个G，使用rstudio下载目前有2个G，我感觉还差一半。我重新跑了Rscript $scriptdir/tcga_gene_exp_download.r -p TCGA-KIRC -m 这个...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...及部分动物的GO分析网站，此外，网站还涉及物种相关的数据可供用户下载。而用户选择的分析包括Singular Enrichment Analysis (SEA)、 PAGE (Parametric Analysis of Gene set Enrichment)、 BLAST4ID (Transfer IDs by BLAST) 、SEACOMPARE (Cross comparison of SEA)等。...
...识，又要懂得计算机知识，同时做到这两点才能从生物大数据中挖掘到生命的奥秘。在一个没有生物信息分析基础的实验室，想成为一名生物信息分析专家很不容易，因此，我们推出了组学大讲堂：主要发布生物信息分析技能和...
按照RNA-seq课程教的方面，将自己的课程数据换成自己的数据，得不到结果。中间不知道哪里错了，麻烦老师给个解决的办法，谢谢
...and CountSummarizer 前者使用cr调用，用于从根据参考列提取数据， 比如有一个文件想根据这里的某一列提取行，参考数据如下 使用代码，得到结果 后者使用ex调用，功能复杂一点，用法比较多不一一距离，常用于丰度估计 ...
...后，点击：Search Enriched GO terms即可完成分析。 以部分数据为例，选择人类、单列基因、提交Gene symbol 选择all 并按照默认的设置开始分析，可以获得如下结果：（以Process为例）： 计算的结果在网页中会有具体的解释，根据解...
...称文氏图，是科研文章中最常见的图，可以用来表示多个数据集之间的关系。当然也可以进行集合运算。绘制韦恩图的工具有很多，在此，小编简单介绍几种在线绘制韦恩图的工具。 1. Venny 2.1 软件地址：http://bioinfogp.cnb.csic.es/...
> #args=commandArgs(TRUE) > ###通过阅读文献获得感兴趣的数据对应的登陆号，并准备下载 > GSE = "GSE66597" > ########################利用获得的GSE accession 和对应的GPL accession下载数据 ################### > > workdir = "H:/gene_family/GEO...
三代转录组测序数据，如果要进行多个数据合并（比如加测一次），以合并*subreads.bam为例， 1. 需要采用SMRT中的pbmerge, 不能采用samtools 的merge 。 2. 需要采用pbindex 对bam 文件进行index, 也不能采用samtools index 构建index 构建...