...及部分动物的GO分析网站，此外，网站还涉及物种相关的数据可供用户下载。而用户选择的分析包括Singular Enrichment Analysis (SEA)、 PAGE (Parametric Analysis of Gene set Enrichment)、 BLAST4ID (Transfer IDs by BLAST) 、SEACOMPARE (Cross comparison of SEA)等。...
...识，又要懂得计算机知识，同时做到这两点才能从生物大数据中挖掘到生命的奥秘。在一个没有生物信息分析基础的实验室，想成为一名生物信息分析专家很不容易，因此，我们推出了组学大讲堂：主要发布生物信息分析技能和...
三代转录组测序数据，如果要进行多个数据合并（比如加测一次），以合并*subreads.bam为例， 1. 需要采用SMRT中的pbmerge, 不能采用samtools 的merge 。 2. 需要采用pbindex 对bam 文件进行index, 也不能采用samtools index 构建index 构建...
> #args=commandArgs(TRUE) > ###通过阅读文献获得感兴趣的数据对应的登陆号，并准备下载 > GSE = "GSE66597" > ########################利用获得的GSE accession 和对应的GPL accession下载数据 ################### > > workdir = "H:/gene_family/GEO...
...后，点击：Search Enriched GO terms即可完成分析。 以部分数据为例，选择人类、单列基因、提交Gene symbol 选择all 并按照默认的设置开始分析，可以获得如下结果：（以Process为例）： 计算的结果在网页中会有具体的解释，根据解...
请问用甲基化数据做WGCNA，beta值过低怎么办？
求助各位大佬：六年前在一家公司做了外显子芯片，他们交付的数据文件是IDAT文件，现在想打开文件无法找到可以打开该文件的方法。
从测序公司拿到数据，或者从NCBI上下载了一些公开的数据，如何判断该数据的测序文库是不是采用了连特异性的建库方法？一般有如下几种方法： 1. 测序数据的GC含量分布 如果是普通的转录组测序文库，那么就会存在Read1, Read...
具体表型说明见官网：https://www.omim.org/help/faq 1.数据库编号，每一个收录条目都使用了一个唯一的6位数字表示： 数字 说明1-----（1000000）；2-----（200000）常染色体基因位点或表型（创建于1994年5月15日前）3-----（300000）X染色...
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...mers.fasta 文件，文件格式序列名字需要加上5p或3p，自己的数据有一个barcode.fasta文件，但是序列名没有标5p或3p，barcode和primer是有什么关系，lima输入的barcoded_primers.fasta文件应该是什么样？不是公司给的barcode.fasta文件么？
...因motif多，有的motif少： 转录组表达验证： 作者转录组数据均来自别人文章中的数据，利用别人的数据发自己的文章，节约不少实验经费，对于经费紧张的科研老师来说值得借鉴：A： HKT基因在葡萄不同组织中的表达(Fasoliet al....
...分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGC...