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问题 Linux服务器上安装R之后，在R环境下利用githubinstall安装QTLseqr出现问题，如何解决

利用githubinstall 安装github上的QTLseqr（老师介绍的），出现如下错误，应该怎么办呢

问题 黄老师，用的你在github上的qtlseq，运用原始数据，从cleanreads开始运行qtlseq，出现以下错误，请问该如何解决

qtlseq是用conda安装的

问题 Use of uninitialized value $l in numeric lt (

bcftools mpileup -Ou -f 02428.genome.fa I662_sorted_dedup_reads_realigned.bam.recal.bam| bcftools call -c| vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 100 | gzip > 3dilpoid.fq.gz 做PSMC的准备文件vcfutils.pl vcf2fq总是报错Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566. 

问题 Mac中RStudio安装XLConnectJars包出错

> library(XLConnect)载入需要的程辑包：XLConnectJarsError: package or namespace load failed for ‘XLConnectJars’: loadNamespace()里算'rJava'时.onLoad失败了，详细内容：  调用: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)  错误: 无法载入共享目标对象‘/Library/Fram...

问题 提取蛋白编号信息

cp @omicsgene 老师，按照视频的脚本仔细核对没有错误，编译执行后也有没有报错，但pep.fa文件一直是空，文件名字没有空格，是不是文件读取权限向题 如果脚本有问题，编译起来就会报错，还得请教老师来解决，谢谢 use...

问题 执行fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc报错

...Linux系统，并把内存改为9G时候，仍然报错，与上述一样的错误，

文章 遗传进化英文方法参考

...old was set as 1/n (n, total SNP number).     基因组重测序数据分析视频课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ或者扫码二维码：     Reference [1] Li H, Durbin R. Fast and accurate short read alignment with Burrows–Wheeler transform. Bioinformatics.2009; 25(14):1754...

问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

文章 inferCNV 测试

...-o infercnv3 # random_trees 聚类方法最多 8类 肿瘤克隆进化分析需要 Rscript infercnv.r -i ../12.niche/molecular_niche.GraphST_clusters.qs  \   -r "normal"   --annotations_file  cellanno.tsv  --gene_location hg38_gencode_v27.txt \      --cpu 20 --hmm  --denoise  --an...

问题 群体遗传学GWAS课程docker很多命令无法运行

...e Used [perl  ../bin/Plot_XX.pl ] to Plot the LDdecay 只能产生很小的结果文件，前面也有一些命令运行不了

文章 linux下解压命令

...很多压缩文件，种类较多，这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩。 .tar  解包：tar xvf FileName.tar 打包：tar cvf FileName.tar DirName 要注意  tar 是打包，而不是压缩哦！ .gz 解压1：gunzip FileName.gz 解压2：gzip -...

问题 动植物基因组课程，数据筛选步骤提示数据库错误

... Error: Not a valid version 4 database.   搜索百度要么下载版本4的数据库，要么 更新blast+ （https://blog.csdn.net/zhangjunya/article/details/108279859）。查看了一下课程所用镜像和数据库，无法操作啊（能力有限），还是请老师帮忙吧，谢谢！...

问题 挂载共享文件夹，每次打开bio-linux都要重新挂载sudo mount -t……

我自己在Oracle VM VirtualBox里重新设置了一个新的共享文件夹路径（D:\Job……），但每次打开bio-linux都要重新挂载，要输入sudo mount -t vboxsf gene_family1 /home/manager/gene_family1 可以挂载一次，以后每次不用重输挂载命令吗

问题 比较基因组学分析共线性中 No module named jcvi.compara

我是下载安装的课程中的LINUX 一个报错：manager@bl8vbox[mcscan_between_genome] /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Pp --cscore=0.7 /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python: No module named jcvi.compara 之后我去看了根目录下是否...