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问题 非模式物种KEGG富集分析报错 X is null so the result will be null

文件路径都检查没有问题,但是运行代码后,出现如下报错

问题 非模式物种KEGG富集分析报错 X is null so the result will be null

文件路径都检查没有问题,但是运行代码后,出现如上报错

文章 racon 安装报错:

...p; cd racon && mkdir build && cd build cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release .. && make cmake -DCMAKE_BUILD_TYPE=Release -DZLIB_LIBRARY=/share/work/biosoft/zlib/lib/libz.so.1.2.8  -DZLIB_INCLUDE_DIR=/share/work/biosoft/zlib/include ..

问题 变异结果统计与绘图展示

... -vcf    <str>   required, input vcf file to stat;         -type   <str>   required, file type,snp or indel          -od     <path>  opti onal, directory where output file produced, default cwd         -help           help 这个直接在脚本里...

问题 你好,我遇到了和你一样的问题,Circos could not find the configuration file,你解决了吗?谢谢

文章 国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”

... Q, Ma S, et al. Comparative genomics reveals convergent evolution between the bamboo-eating giant and red pandas[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2017, 114(5):1081-1086.

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...cation | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com) 数据可用性:The entire genome resequencing data have been deposited at GenBank under the accession PRJNA356989.  想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据,看了一些下载教程,方法各异,看完思路还是...

问题 输入绘制circos图时出现错误

...perl /home/manager/share/scipt/circos.pl --chr chr.txt --circle link.txt --type link --circle text.txt --type text --od circose1但是显示Can't open perl script "/home/manager/share/scipt/circos.pl": No such file or directory,哪位老师能知道解决的方法?

问题 共享文件夹出现/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device此命令怎么解决

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 纠错软件-HECIL

HECIL(Hybrid Error Correction of Long Reads using Iterative Learning):  这是一款基于二代数据比对,采用迭代学习的方法对pacbio 等长读长序列进行纠错的软件。该软件的第一作者居然是来自IBM。 1. 软件的安装 安装比较简单,从github 上下载...

文章 RDA CCA 分析Hellinger转化问题

...frow = c(2, 2))#ordiplot(pca_sp1, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')#ordiplot(pca_sp2, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')#ordiplot(pca_sp3, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')ordiplot(pca_sp1, dis = 'site', type = 'n', choices = ...

文章 蛋白质组和转录组相关性图绘制

... by.x='protein_id', by.y='#ID') # 基于调控关系进行分组 merge_df$type <- paste(merge_df$regulate_p, merge_df$regulate_g,sep = '_') types <- c('Down_Down','Down_Up','Up_Down','Up_Up') merge_df[!merge_df$type %in% types,'type'] <- 'Other' # 绘图 mycol <- c("#e41a1c","#ff7f00"...

文章 基因组注释流程,PASA mysql 数据库启动 exited

...--verbose --help --log-bin-index=/tmp/tmp.ogWM7TzzGmmysqld: Can't read dir of '/etc/mysql/conf.d/' (Errcode: 2 - No such file or directory)mysqld: [ERROR] Fatal error in defaults handling. Program aborted! 由于是mysql5.7更新导致的,解决方法有三个, 1.取消-v参数: ...

问题 win10 中docker 下载镜像报错:no matching manifest for windows/amd64 10.0.18362 in the manifest list entries

文章 怎么用Perl脚本得到反向互补序列

...everse_complement_IUPAC {        my $dna = shift;        # reverse the DNA sequence        my $revcomp = reverse($dna);        # complement the reversed DNA sequence        $revcomp =~ tr/ABCDGHMNRSTUVWXYabcdghmnrstuvwxy/TVGHCDKNYSAABWXRtvghcdknysaabwxr/;        return $revco...