svg2xxx运行报错

/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...

/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Manager is deprecated and will be removed in a future release at java.base/java.lang.System.setSecurityManager(System.java:425) at org.apache.batik.util.ApplicationSecurityEnforcer.installSecurityManager(Unknown Source) at org.apache.batik.util.ApplicationSecurityEnforcer.enforceSecurity(Unknown Source) at org.apache.batik.apps.rasterizer.Main.execute(Unknown Source) at org.apache.batik.apps.rasterizer.Main.main(Unknown Source)


这个异常和 Java 的安全管理器(Security Manager)有关。从 Java 17 开始,安全管理器已经被标记为过时(deprecated),并且在未来的版本中将被移除。这个异常提示是因为你的代码或者依赖的库试图设置或使用安全管理器,而这在最新的 Java 环境中不再被支持


解决这个问题的简单办法是在执行前将自己的旧版的java加到环境变量里,
比如

exportPATH=/share/work/biosoft/java/jdk1.8.0_161/bin:$PATH

然后就能正常执行,或者直接修改perl执行测序,将里面 的java改为绝对路径,



  • 发表于 2024-03-26 11:31
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