...数据标准化、WGCNA-加权基因共表达网络分析 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
老师你好，我在学习基因家族分析（生物信息）这么课程，在学习的过程中遇见了一个问题。今天正好学习到提取蛋白Motif这块内容，按照老师的讲解，同时一步一步的操作。在里面使用到一个meme命令的时候，系统提示我...
...家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...
...图技能，我们推荐：R语言绘图基础（ggplot2) 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...
...子结构但get_gtf.pl 提不出来 这是gff文件第九列信息样子 ID=cds39033;Parent=rna44550;Dbxref=GeneID:105319604,Genbank:XP_011415503.1;Name=XP_011415503.1;gbkey=CDS;gene=LOC105319604;product=neprilysin;protein_id=XP_011415503.1 查询所用的id号是 XP_011415503.1 我...
...对应基因的cds序列，脚本会读取第一个文件的第一列的ID信息，根据ID提取相应的序列： seqkit grep -f WRKY_IDlist_final.txt ../01.data_prepare/Arabidopsis_thaliana.gene.cds.fasta -o WRKY_cds_final.fa 那得到对应基因的完整基因序列的命令如下，但...
...6.8 版本。6年的时间，高通量测序技术迅速的发展，生物信息爆炸，基因的功能注释更加的全面，更加的详细。如果你还想采用DAVID进行功能分析，那就采用最新的版本吧。
...通过已知TF寻找未知TFBS，或通过已知TFBS找出其对应TF生物信息学分析（computational methods）:生物信息学方法主要是基于已有的研究数据，用于转录因子和序列间相互关系的预测，即通过序列保守性分析，通过已知TF预测未知TF，或...
...的样本进行了iTRAQ蛋白质组学检测，并进行了相应的生物信息学分析。 03/研究结果之蛋白质鉴定及差异分析 作者通过iTRAQ分析，共鉴定出6285个蛋白质，三个差异组合（O vs. T、T vs. C、C vs. O）的差异蛋白数分别为：875、656、538。...
...的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物信息学中非常重要的任务，对于研究物种的演化、基因的功能和结构以及疾病的发病机制都有很大的帮助。基因组比对的过程一般包括以下几个步骤：1.序列获取： 首先需...
...小编也把具体的统计结果（包括：负责人、单位、题目等信息）整理成了Excel表，如下图所示： 如您需要此统计表格，请关注组学大讲堂微信公众号，转发该文章至您的朋友圈并截图，然后在公众号对话框内发送截图并留言“...
在带有GROUP信息的structure图当中，每一个K值柱状图下面的样品顺序都是相同的，能不能直接在最下面或者最上面显示样品名而不是在每个图下面显示，代码因该如何修改 这个是绘图的代码 p<-plotQ(qlist,imgoutput="join",#showlegend=T,r...
...目都会遇到VCF文件，有时候会需要挑选出某些区域的变异信息。这里有简单的方法可以实现。 我们需要用到vcftools这款软件，它是专门处理VCF文件的工具，只需要一条命令就可以完成。 vcftools --vcf Variants.snp.unknown_multianno.vcf --...
...过组合不同的外显子，形成不同转录本的过程，在生命的信息传递过程中发挥着重要的作用；今天就给大家分享一篇利用TCGA数据库癌症转录组数据可变剪切事件进行生存分析，构建预后模型分析的文章，目前可变剪切在癌症的...