找到约 15 条结果

文章 linux下安装java

java安装 yum search java 先看下java对应的版本,我装的是1.8版本的java包。 yum install java-1.8.0-openjdk.x86_64 装好了就能用java命令了。 配置下JAVA_HOME配置文件: vim /etc/profile把下面填进去 #set java environmentJAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-1.8.0-o...

文章 pophelper包安装

...m GitHubremotes::install_github('royfrancis/pophelper') 安装成功后加pophelper包 # load library for uselibrary(pophelper) 详情可参考:https://www.royfrancis.com/pophelper/

文章 TCGAbiolinks 下临床数据,警惕有多次随访数据

在我们的《TCGA-生存分析》课程中,我们提供了临床数据的下方法。有学员反馈,有些癌症有多次临床数据,随访时间还一样。我细致的看了一下出现这种情况的原因: 1. 随访曾中断过: 存在多次随访 2. 出现了新的癌症:...

文章 荧光实时定量PCR常见问题解析

...时,需要通过软件来进行设计,网络上有许多免费的以及在线的设计软件可以使用。       Q:可否设计羊源、猪源等其他物种基因的qPCR引物?   A:可以设计,但对于人,大鼠,小鼠常规模式生物以外的基因(由于无法在N...

问题 gatk VariantFiltration这一步的过滤,我看到gatk 官网上SNP和indel的过滤条件有点一样。是否可以把SNP和indel从all.raw.vcf.gz提取出来个各自硬过滤后再合并做后面的分析

文章 Illumina microarray未标准化数据分布

...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...

问题 外泌体检测方法

...程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学...

文章 安装R包ggpubr 报错

...ation failed for package ‘tidyr’ 这个是因为R更新4版本以后的报错,而你的R版本是3.* 所以报错,建议安装老板版本的tidyr 之后再安装ggpubr

问题 cnvpytor 运行

分析重测序数据时,该命令没有运行。

问题 泛基因家族分析-SV和表达量

老师您好,我执行了以下操作,发现WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${ref}结果中,有的品系的基因组没有了,这是正常的吗? #删除一些需要的基因的表达量(B73的一些基因在其他物种中存在同源基因) perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRK...

文章 circos-调整基因组圈图的图片大小

...onf>> radius*=2000p</image> 推荐课程: 基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实...

问题 533个品种先根据盐浓度下发芽率,初步在盐胁迫下挑选120个具有同发芽时间的品种(发芽的品种忽略,会导致出现重复表型),然后进一步进行详细表型分析(增加测量性状,如根长、芽长、光谱性状),然后做GWAS关联。

这样的试验设计是否可以回答120个品种,样本太少的问题。

文章 《转录组代谢组个性化数据分析》课程上架

你是否在转录组代谢组数据分析的迷宫中徘徊,渴望掌握关键技能,推动科研项目的进展?我们的 “转录组代谢组个性化数据分析” 课程重磅来袭,为你量身打造通往科研成功的捷径! 课程适合学员:拿到公司给的结果后看...

问题 老师您好,做基因家族分析有几个问题明白想问问您:(1)实在找到组装到染色体的基因组,可以用scaffold水平的画基因重复性图吗?会会影响发文章 (2)能分析两个比较有相关性的基因家族或者结合转录组分析,增加一点文章接受几率?(3)用hmmsearch筛选蛋白,构建新模型,再筛选,筛出来200多个蛋白,但是alignment之后发现保守结构域差别很大,gap特别多,是出了什么问题吗?

问题 tcga生存分析

自己按照老师在社区里面发的那个http://www.omicsclass.com/article/173 整理了一个exprSet文本,前面运行都是正常的, 到unicox(‘某基因’)这一步以后,能导出计算的数值, 我想画成图,比如has.mir.206这个miRNA, > group <- ifelse(e...