找到约 15 条结果

文章 linux 重定向

...脚本时。用一个简单的python脚本说明： 脚本如下： # coding: utf-8 if __name__ == '__main__': print 'Hello' int('Hello') 该脚本先输出"Hello"，这一步是正常的，然后将"Hello"转换为int类型，这里会报错。直接运行： $python test.py > txt ...

问题 运行WGCNA代码后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总显示文件大小为0

...感谢 老师，我刚重新运行后，看到错误提示是：Error in dev.off(): internal read in PDF_endpage   请问该怎么解决呢？

问题 用string网站预测蛋白质互作网络，为什么相隔两个月预测的两次结果不一致？

用string网站预测蛋白质互作网络，六月底进行了一次，hide disconnected nodes in the network后有40个节点，隐藏了20个节点；八月低在string进行了同样的操作，hide disconnected nodes in the network后有63个节点，节点数没有减少；这两次使用的...

文章 BLAST+使用方法

...bles/blast+/LATEST/ 使用方法如下： 格式化数据库makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -parse_seqids -out dbname参数说明:-in：待格式化的序列文件-dbtype：数据库类型，prot或nucl-out：数据库名 蛋白序列比对蛋白数据库（blastp）blastp -query seq.fast...

文章 地球上物种总数到底有多少？？

...Mora C, Tittensor D P, Adl S, et al. How Many Species Are There on Earth and in the Ocean?[J]. Plos Biology, 2011, 9(8):e1001127.Locey K J, Lennon J T. Scaling laws predict global microbial diversity[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 113(21):5...

问题 建立共享文件夹失败错误提示wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare

...nt: wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare,       missing codepage or helper program, or other error       (for several filesystems (e.g. nfs, cifs) you might       need a /sbin/mount.<type> helper program)       In some cases useful info is found in sysl...

文章 科研小白：生物实验做不出来是种什么体验？

...he arginine methyltransferase CARM1 represses p300•ACT•CREMτ activity and is required for spermiogenesis 期刊：Nucleic Acids Research IF：10.162 产品名称：p300 Polyclonal Antibody 这两篇10分以上的文献，所使用的的抗体均来自同一家公司——Elabscience！ 相...

文章 感兴趣的蛋白，如何研究它的结构-Phyre2工具使用介绍

...本次任务(Job)命名，再粘入蛋白序列，建模方法一般默认Modelling mode，最后一项任务用途默认other即可，最后点击Pryre Search开始预测任务。 一般情况下建模比较耗费时间，一般需要30min-2小时不等，不过此时，我们可以关闭此页面...

问题 重测序遗传变异过滤

...师请教下，在对群体的变异进行过滤的时候，为什么min and max-alleles都是2，在群体中，一个位点的变异很可能大于2呀，这样的设置不会导致过滤掉丰富变异的位点吗？vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-INFO-all --stdout --maf 0...

文章 抗体生产的三个阶段-重组抗体的几种形式详解

...链双特异性抗体。这些双特异性抗体有多种形式，包括tandem scFvs、单链双抗体、TandAbs、DART、 dock-and-lock（DNL）以及纳米抗体等。   更多重组抗体详情可以关注：https://cn.sinobiological.com/resource/antibody-technical/recombinant-antibody-overvie...

问题 genome-annotation缺失tantan

在用omicsclass/genome-annotation镜像进行注释时报错，代码如下“funannotate mask -i pilon_polished2.fasta -o tz-mask.fasta”，提交后显示“Missing Dependencies: tantan.  Please install missing dependencies and re-run script”。请问老师如何解决依赖项缺失问题

问题 GEOquery 下载不了数据

... > if( !file.exists(workdir) ){ +   if( !dir.create(workdir, showWarnings = FALSE, recursive = TRUE) ){ +     stop(paste("dir.create failed: workdir=",workdir,sep="")) +   } + } > #设置工作路径 > setwd(workdir) > ###获取数据 > gset = getGEO(GSE, GSEMatrix =TRU...

文章 GWAS模型描述方法

... naive: y= x + e, fixed: y = x + q + e, kinship: y=x+z+e (Pariseaux and Bernardo, 2004), QK: y = x + q + z + e (Yu et al., 2006), eigenstrat: y = x + q + e (Price et al., 2006; Malosetti et al., 2007).   参考： https://mran.microsoft.com/snapshot/2018-04-07/web/packages/lmem.g...

问题 重测序分析

...r $tmpdir  -R $REF --batch-size 5  \ #   --reader-threads 5 --max-num-intervals-to-import-in-parallel 5 \ #   --genomicsdb-workspace-path db -V p1.g.vcf.gz -V p2.g.vcf.gz -V pool1.g.vcf.gz -V pool2.g.vcf.gz #样本太多,可以输入列表 cd $workdir/4.snp_indel/GATK #生成列表 ls *g...

问题 补充细节： 运行WGCNA代码后，12_Network heatmap plot_all gene.pdf 这个文件总显示文件大小为0

...感谢 老师，我刚重新运行后，看到错误提示是：Error in dev.off(): internal read in PDF_endpage   请问该怎么解决呢？