数据下载： wget -c "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE148071&format=file" -O GSE148071_RAW.tartar xvf GSE148071_RAW.tar 数据map.txt 准备： GSM4453576 P1 71 female LUSC advanced GSM4453577 P2 62 male LUAD advanced GSM4453578 P3 67 male LUSC advanced GSM4453579...
...表，做好高级个性化分析发表高分1区不是梦！T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接：T2T基因组组装与注释分析；动植物泛基因组分析 ；比较基因组分析4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章，篇篇10+分，缩短分析周期，...
...、 and RNase L pathways识别并降解，从而产生大量的病毒衍生小RNA（Virus-derived small RNAs）。这些小RNA具有反映其来源的分子特征。首先，可以使用小RNA来组装病毒序列并识别它们来源的病毒。第二，小RNA的其他分子特征如大小，极性...
更新一下细节： 问题应该出在lastdb这一步。是不是blast出了问题？关键是我一个月之前还能用的，中间重装了一次linux系统（还是用的组学大讲堂的装机包），但是这次用就不行了。 生成的last文件为空，关键是原来可以跑成功...
...析策略进行分析； 若所研究物种与参考基因组比对效率比较低，则需要按照无参转录组分析策略进行分析。 10、做完转录组之后一定要进行Q-PCR验证么？一般验证多少个差异基因合适？ 目前来说，Q-PCR验证是转录组测序分析必...
报错信息 01.prepare_data.sh01.prepare_data.sh.o
因为这个家族只在拟南芥里鉴定过，只有18个成员，我做的亚族只有4个成员。现在拟南芥和大麦构建进化树的结果没法做比较
使用说明： metadata中按列分组，做差异比较分析，可以利用 merge_tsv_files.r 或者 merge_metadata_genexpdata.r 将比较的信息合并到metadata中： usage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts/compare_stat_boxplot.r [-h] -m filepath -v variate [...
鉴定得到的motif和已知该基因家族的motif相似性较低，或者说含有更多未知的motif，已经扩大了motif的搜索结果，并且多次调整motif搜索范围，得到的已知该家族的motif数量还是较少。是什么原因呢？
高通量测序这几年比较热门，蛋白质组学也慢慢火起来了。 那么分析蛋白质组的数据的软件，那个值得推荐呢？ 我查询了不少资料，发现不少蛋白质组分析软件都偏向于收费，而且很多都是windows上运行。在众多软件中，我比...
...，因此我们对功能相关的基因作为一个整体做GSEA分析，比较集合中基因整体的表达量差异得到的分析结果更可靠。 3.目前GSEA提供的功能基因分类数据库有以下8种，主要是与人类基因相关的分类数据库MSigDB，动植物目前没有，...
...select * from students where id = 1; where后面支持多种运算符：比较运算符、逻辑运算符、模糊查询、范围查询、空判断 4.1 比较运算符：等于= 等于> 小于< 大于等于>= 小于等于<= 不等于!=或<> 例如： ...
...效机器学习算法，可以用于对样本进行分类，也可以用于回归分析。它属于非线性分类器，因此可以挖掘变量之间复杂的非线性的相互依赖关系，对于经常呈现离散、不连续分布的微生物群落数据而言尤其适用。 简单的说，随...