工作单位： 福建农林大学坐落于福建省省会福州市闽江畔，空气清新风景优美，是福建省重点建设3所高水平大学之一。海峡联合研究院具有完善的软硬件平台与国际化的科研氛围。本课题组依托海峡联合研究院代谢组学中...
合并成supergene时报错，是因为我的序列过多吗，应该是5000多个片段，而且有时会卡死。
...用的韦恩图绘图工具，希望对您的科研能有所帮助！祝您工作生活顺心快乐！ R语言也可绘制韦恩图，具体请见 R语言绘图基础（ggplot2) 。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越...
...体） 计算方式见下文 eQTL分析之协变量计算 02 — 下载安装方法和使用方法 下载： 软件github：https://github.com/broadinstitute/tensorqtl pip install pip@git+https://github.com/broadinstitute/tensorqtl.git 同时需要一个plink2(...
...or CountSummarizer, DataFetcher and TaxonomyAdderauhtor, Xunlast modified, 2023-07-07Mail, makise.kurisu.yoru@gmail.com'''import pandas as pdimport argparseclass CountSummarizer: def __init__(self, args): self.args = args def norm_expr(self, probe_expr_df, norm_type): ...
... , -format => 'fastq');$in2 = Bio::SeqIO->new(-file => "D:/share/scripts/test_2.fastq" , -format => 'fastq'); $out = Bio::SeqIO->new(-file => ...
...定义的基本语法如下： function_name <- function(arg_1, arg_2, ...) { Function body 函数组件 函数的不同部分 ： 函数名称 -这是函数的实际名称。它作为具有此名称的对象存储在 R 环境中。参数 -参数是一个占位符。当函数...
...查了level_tree_sample.py脚本，发现报错出现在第98行（见图2），这行代码我理解的意思应该是从左往右以K_细菌到右依次检索，按类别分组，我回查了文件“5.pick_otu_qiime/pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.txt”（数据见图3），也看不出...
...类命运！ 但是，你不必沮丧，因为全世起码有99%的科研工作者跟你一样啊！ 科研只是个职业，跟你在公司打卡上班打卡下班没什么不一样。 如果非要问我如此苦逼又不挣钱的工作的乐趣在哪里的话， 那我只能引龙应台先生...
...perl /work/scripts/PAV_list.pl -pangenel foxtail_millet.GRASgene.pan-genes2.list -spid new_id2.txt -unigenel foxtail_millet.GRASgene.uniq2.list -fam GRAS 下面是我的foxtail_millet.GRASgene.pan-genes2.list 这是foxtail_millet.GRASgene.uniq2.list 这是new_id2.txt 老师我现在的问...
...这篇文章的主要内容如下： 作者选取了10个肝癌病人共21个样本，取样类型包括：primary tumor (T)、portal vein tumor thrombus (P)、metastatic lymph node (L)、non-tumor liver (N)；通过单细胞测序共得到28,687 non-tumor liver cells和4,414 primary tumor cells。...
明明文件大小不大，为何到了#合并成supergene seqkit concat aln_out/*.pep_aln.renamed > single_copy.pep_msa.fasta这一步的时候总是被Killed
...看这个circRNAs到底是何方神圣吧？说不定可以成为您科研工作的有力武器！ 1 环状RNA是什么？ circRNAs（Circular RNAs，环形RNA分子）是一类不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码RNA分子。 2 环状RN...
...外界对 BAT 传统三巨头的直观印象。 很可惜我没有在 BAT 工作过，所以对三巨头的内部工作机制以及文化没有切身感受过。 但身边不乏有曾经和正在 BAT 工作的朋友，跟他们的聊天和互动中也略知一二。 而今天想聊聊的是我有...