...的参数,但是一般使用的参数如:-p、-i、-d、-o、-e等几个。 -p: 执行的程序名称-d: 搜索的数据库名称-i : 要查询的序列文件名(Query File)-e:(数学)期望值(Expectation value),E值是个统计阈值,缺省值10, 意指比对结果中由于随机偶然性...
使用说明: $Rscript $scriptdir/enrichKEGG_pip.r -husage: /work/my_stad_immu/scripts/enrichKEGG_pip.r [-h] -g gene.list [-d ann.db] [-t idtype] [...
...最近,其次是A基因组,与D基因组最远。此外还鉴定出多个G基因组和比克氏棉基因组特有的染色体结构变异,包括G基因组5号和13号染色体上特有的两个易位片段,以及比克氏棉与澳洲棉12号和13号染色体间特有的两个倒位片段。...
使用方法: $Rscript $scriptdir/GOChord_plot.r -h usage: /share/nas1/fangs/test/Ferroptosis-Related/TCGA-ESCC/scripts/GOChord_plot.r [-h] -g GO_DATA -d DEG_DATA [--no_logFC] [--gene GENE] [--GO GO] [-z GENE_SIZE] [-S GENE_SPACE] [-s GO_SPACE] [-t TITLE] [-o OUTDIR] [-p PREFIX...
...等)与普通电脑上的硬件还是有区别的:也就是要求性能更好更稳定,自然价格也就更贵一些。例如,一块普通的4T硬盘与一块4T的服务器硬盘价格就相差3倍以上: 由于服务器24小时开机且高强度不间断运行,硬件一旦崩溃,...
mcscan分析蛋白序列得到circose blast得到串联重复基因
MADS.txt中的基因数是94个,为什么显示的图里只有41个
1、并行系列一 线程是一个单一的执行流程,它是所有程序执行过程中最小的控制单位,即能被 CPU 所调度的最小任务单元。线程与进程之间既有联系,又完全不同。简单地说,一个线程必然属于某一个进程,而一个进程包含...
...式,这里是exfat 那如何挂载?最简单的就是用 umask、uid 和 gid 选项来控制文件权限 sudo mount -t exfat -o uid=$(id -u),gid=$(id -g),umask=000 /dev/sdb2 /export/data2 uid=$(id -u):将当前用户设置为挂载设备的所有者。 gid=$(id -g):将当前用户组设...
...象是弓形虫(Toxoplasma gondii),研究者选取了弓形虫的三个发育时期的样品:T-速殖子(tachyzoite)、C-包囊期(bradyzoites-containing cyst)以及O-卵囊期(sporulated oocyst),每个时期两个生物学重复。 02/研究方法 本文没有高深的实...
...用Fastsimcoal2.7利用SFS模拟种群动态历史,一般是使用第二个功能,需要三个输入文件,这三个文件的前缀必须相同: .tpl 模版文件(参数文件):用来指定历史事件、migration、样本大小、突变率重组率等等。注意,这里的突变...
...的上游。 2. 转录组起始点(TSS):是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基,通常为一个嘌呤(A 或G),即5’UTR的上游第一个碱基;注意转录起始点和起始密码子的区别。 3. 起始密码子和终止密码子:mRNA的开放阅...
...变剪切区分开来。而利用MinION测序仪产生的长read,可以更好地解决这个问题。研究人员利用果蝇的Dscam1基因为例,其存在18,612种可变剪切形式,利用MinION测序仪可以检测到超过7,000种可变剪切形式,而这样的结果利用NGS的短...