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文章 遗传家系图代表意思以及绘制技巧

...为遗传病。通过家系调查可以绘出家系图(或称系谱)来显示某种疾病在家族中的传递特点,借此判断该病是否为遗传性疾病及其遗传方式。家系调查是正确进行遗传咨询的首要步骤和依据。根据家系中某疾病的传递特点,判断...

文章 Cytoscape如何基于点的属性快速对点和相连的线进行颜色分类

...点(以及与该点相连的线)进行颜色着色呢? 譬如下图 显示了miRNA 和靶基因的相互作用,并基于靶基因的类型对网网络图进行了颜色处理,方便显示各个分类: 绘图的原始数据基本格式如下,仅两列: miRNA Target ath-miR15...

问题 老师,我做进化树+基因结构+motif一张图全显示的时候是这个样子,为什么有很多基因没有基因结构?但是我在GSDS上得到的基因结构图是长这个样子的,这是为什么啊?

文章 cBioportal使用教程

...。step3:输入所要分析的基因PTEN提交后即可分析1.oncoprint显示7%的样本发生基因改变,类型大部分为PTEN缺失2.plot可以绘制各种比较结果图,并可以根据需要更改参数3.co-expression可以查看所分析基因与其他基因的相关性4.通过comparis...

问题 老师您好!我在做mcscan分析时blastall出错,显示两个错误,首先是unable to open output file mcscan/ChaShu.blast,第二个是return non-zero status. 请问老师这种情况应该怎么处理呀?

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...单元即可选中,选中后按住左键可以左右拖动,右键即可显示编辑任务栏,各参数如下:Edit:编辑元素的颜色、形状、纹理等;Add:添加元素;Duplicate:重复添加选中的元素;Delete:删除;Move:移动;Zoom In:放大画布;Zoom out...

问题 你好!我参照《医学癌症TCGA-甲基化生存分析》中的方法做甲基化生存分析模型独立性验证时,将患者年龄分为3组分别进行验证,运行代码如图,但是运行后总是报错显示“找不到对象……”请问该如何解决?非常感谢!

问题 老师,您好,我下载下geo原始数据,经标准化处理后,基因的表达值显示为 964316794613767;9 这是什么意思,不是说过表达值经log处理基本上在0-几十的样子,怎么变成这样了?这两个数字代表什么意义?

文章 IF=8.86|肝癌免疫相关lncRNA预后标志物文献解读

...专注于肿瘤免疫浸润的特征在癌症的诊断、评估和治疗中显示出有希望的预测和预后价值 数据分析思路 从TCGA数据库获得LIHC基因表达谱数据,ensemble获得gtf文件,根据注释文件得到lncRNA的表达数据;从ImmPort获得免疫相关基因...

问题 生存分析datExpr数据的bcr_patient_barcode列是 . 号分隔,后续报错

...patient_barcode",by.y="bcr_patient_barcode") 的时候clin和exprSet都会显示0 obs

文章 biolinux导入虚拟电脑失败,报错VBOX_E_FILE_ERROR VirtualBox Machine settings file already exists.

症状如上图,显示为:VirtualBox Machine settings file already exists.                   明细:Machine settings file 'C:\Users\administrators\VirtualBox VMs\Bio-Linux-8.0.7\Bio-Linux-8.0.7.vbox' already exists.         返回 代码: VBOX_E_FILE_ERROR  (0x80BB0004) ...

文章 biolinux虚拟机安装指南

...图 | 轻松搞定Krona图 | 进化树+基因结构+motif—1张图全显示| 基因组间共线性图 | 多方法、多版本的微生物网络图绘制课程 | 热图竟然还能用Excel来画 | Cytoscape-网络图绘图技巧 | 怎么做一张好看的分类学树状图 |

文章 Root microbiota assembly and adaptive differentiation among European Arabidopsis populations

...之间的相似度高于特定采样点上不同区室之间的相似度,显示拟南芥根部微生物在大陆范围上的结构趋同性。通过Bray-Curtis距离的变异多变量方差分析(PERMANOVA)证实了这种观察结果,这表明位点因素比采样部位更能解释真菌和...

文章 anaconda快速搭建python学习环境-windows

...写代码和运行代码,代码的运行结果也会直接在代码块下显示。如在编程过程中需要编写说明文档,可在同一个页面中直接编写,便于作及时的说明和解释。 我们安装完成anaconda之后,jupyter就已经安装成功了,因为anaconda中已...

文章 PBS 命令

...                  -q 列出队列状态,并以alternative 形式显示                          -au userid 列出指定用户的所有作业                          -B 列出PBS Server 信息                          -r 列出所有正在运行...