生存分析datExpr数据的bcr_patient_barcode列是 . 号分隔,后续报错

attachments-2019-09-orqGMxDt5d7cb1f53d57c.jpg我的文件里都是-符号,结果输入进来就变成了 . 号。并且在进行下一步

# 3. 合并临床信息和表达量信息
############################################################
clin <- clin[clin_info$bcr_patient_barcode %in% datExpr$bcr_patient_barcode,]
exprSet<-merge(clin_info,datExpr,by.x="bcr_patient_barcode",by.y="bcr_patient_barcode")

的时候clin和exprSet都会显示0 obs

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1 个回答

wellth

我已经知道了,应该是没有把正常组织样本剔除,剔除后就ok了

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  • wellth 提出于 2019-09-14 17:31

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