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文章 基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

...体内任何类型细胞的能力。诱导的多能干细胞（iPS细胞）不同于胚胎干细胞（ES细胞），后者形成胚胎的内部细胞团，但也是多能的和原代细胞类似，最终导致构成人体的所有细胞类型。诱导多能细胞最早是在2006年由日本医师和...

文章 windows powershell设置ssh 密钥登录云服务器

...但它作为系统自带的可选功能已经内置集成在系统中。你不需要额外下载安装包，只需在系统设置或命令行中手动开启即可使用。  如何检查与开启 你可以通过以下两种常用方法来启用系统的 OpenSSH 功能： 通过系统设置开...

问题 GO注释：blast了nr数据库并通过blast2go获得了GO注释号；也通过blast了swiss-prot数据库获得了GO注释号。这两个结果需要合并吗？

...iprot.org), using BLASTx (Altschul et al., 1997) with a cutoff E-value 1E-5. Blast results were imported into Blast2Go (Conesa et al., 2005) for GO term mapping. Mapping results were submitted to WEGO (Ye et al., 2006) for GO classification. 他的结果如下： 814 and 745 CDSs with SSR in ge...

文章 非小细胞肺癌（GSE123904）

...i `ls *.afterQC.rds` \    -o $project/01.qc -p lung 单细胞转录组分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

文章 华大的空间转录组 手动标注的组织区域如何添加到数据中

...F DP \    -c DEFP \    -o bin50.DEFP_metadata.tsv#添加分组添加到分析数据中：Rscript addMetadata_to_seurat_obj.r -i afterQC.qs -m bin50.DEFP_metadata.tsv -p bin50python3 addMetadata_to_scanpy_anndata.py -i afterQC.h5ad -m bin50.group.tsv -p bin50

文章 MarkDuplicates 过程中报错：Value was put into PairInfoMap more than once

RNA-seq分析进行SNP calling之前会对bam文件进行一系列处理，包括排序、去重、将落在外显子上的reads分离出来，取出N错误碱基，在去重（MarkDup）过程中出现报错： 是由于fq文件中出现了两次这个reads，在 双端测序的1.fq 和2.fq 文...

文章 绘制简单圈图—RCircos包

...置染色体数据 cyto.info<-UCSC.HG19.Human.CytoBandIdeogram #设置不显示的染色体，如c("chrX", "chrY") chr.exclude<-NULL #设置内部环形个数 tracks.inside<-3 #设置外部环形个数 tracks.outside<-0 #导入上面四个基本参数 RCircos.Set.Core.Components(cyto.inf...

文章 GWAS根据遗传率和QTL的数量产出模拟表型数据

...rg/articles/10.3389/fpls.2019.01794/full#supplementary-material GWAS关联分析课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq

文章 JGI-IMG微生物功能基因组数据库介绍

...JGI）于2005年创立，是综合的微生物基因组数据库及比较分析系统。IMG收录了细菌、古菌、质粒、病毒以及少量真核生物基因组数据，其数据主要来源于NCBI的RefSeq数据库，但是增添了更加详细的注释信息，例如CRISPR序列、信号肽...

文章 检查kegg的map是否能和差异基因对上

我们进行kegg富集分析之后，除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息，还会拿到kegg pathway map的信息，分为html和png的结果展示，大概是这样的结果： 一般来说我们最好检查一下，这里面涉及到得基因和我们的差异基因是不...

问题 perl双层哈希赋值

...次，请问何解？ 我已经听完了咱们perl的全部课程。还是不明白，望高人指点！！！

文章 科研汪：你知道自己是什么“实验垃圾”吗？

...会大妈的灵魂拷问： 你是什么垃圾? 而我们科研汪就不一样了， 因为， 在“实验垃圾”面前， “生活垃圾”分类，还是个小！学！生！ 生活垃圾才分了4类：干垃圾、湿垃圾、有害垃圾、可回收垃圾， 实验室垃圾分类...

文章 gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

...gbff 。应该会有现成的工具来实现常用的基因组注释文件不同格式之间的相互转换。就简单的进行了gb→gff 之间的相互转换。 方法有很多，我只测试了2种： 方法 1： 脚本如下：这个脚本实在太多行了，2300多行，大家直接进网...

文章 bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组

...步处理 SAM 文件，例如转换为 BAM 文件、排序或进行其他分析。

文章 Perl 变量命名规则

变量命名规则： 1.不要与perl中的内置变量名相同如：%ARGV，$a,$b $_ 等等 2.perl中的变量名严格区分大小写 3.建议使用大字母，小写字母，数字，下划线组合命名变量名。其他特殊字符。 变量命名示例 变量名采用 形容词_名...