问题 老师您好！我把顺势作用元件的名称都改成了大写的，但是出现了如下报错Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

老师您好！我把顺势作用元件的名称都改成了大写的，但是出现了如下报错然后根据提示更改设置，但是“具体参考”链接一直打不开还了几台电脑都不行，希望老师指点

文章 perl 多线程

...n()，收割已经创建的线程；             threads->list(threads::all)，返回所有已经创建的线程；             threads->is_joinable()，返回目标线程是否已经完成，等待join；             其他的在perldoc上了，字母文...

问题 全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

...错为： java.lang.IllegalArgumentException: Sample Line68 has an inconsistent number of alleles. The first genotype is diploid, but the genotype at position Chr2:35902177 is haploid

问题 你好 我看到你提出的问题 基因组染色体共线性分析出现 Unable to run 'false OUTFig.gp', Inappropriate ioctl for device 我在使用mummerplot也遇到了相同的问题 如果你解决了遇到的问题 是否可以分享一下你的解决方法 感谢

问题 老师你好，我在qiime2分析数据的过程中在进行第二步生成特征标和代表序列时输出的文件在可视化指令执行后，就提示该qza文件is not a QIIME 2 Artifact (.qza)，无法进行可视化分析，直接进行下一步物种分类时输入文件也存在相似问题，这几步在第一次分析时都没有问题，只是当时进行第三步分析时内存爆满，后重装c盘再次重新运行时出现了这些问题

问题 老师好，我在运行比较基因组学11.time_tree_BV脚本的时候，报错Error: Only bounds for the root age are implemented，修改了几次化石时间节点也没有成功，请问这个是我的化石节点选的有问题么？

文章 ValueError: invalid literal for int() with base 10: ''

... /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout 报错信息如下： markers', 'networkx.algorithms.community.__future__', 'networkx.generators.atlas', 'networkx.algorithms.connectivity.edge_kcomponents', 'pkg_resour...

文章 TCGA 临床随访信息follow up 各列介绍：

...submitter_iddays_to_follow_upadverse_eventadverse_event_gradeaids_risk_factorsbarretts_esophagus_goblet_cells_presentbmibody_surface_areacause_of_responsecd4_countcdc_hiv_risk_factorscomorbiditycomorbidity_method_of_diagnosisdays_to_adverse_eventdays_to_comorbiditydays_to_imagingdays_to_progressiond...

问题 perl双层哈希赋值

... = Bio::SeqIO->new( -file   => "C:/Users/Administrator/cds.fa", -format => 'Fasta'); #读取IDmy $count=-1;my %ID;open IN, "C:/Users/Administrator/KAKS.txt" or die "$!";        #这个文件是blast输出并经过筛选的结果。 my @read=<IN>;foreach (@read){ $count++; ...

问题 老师，求助，转录组差异表达基因分析报错

Rscript $scriptdir/deseq_analysis.r -i $workdir/4.expression/all_gene_count.tsv -g S3_vs_S4.compare.txt  -k $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -r S3 --fdr 0.01 --fc 2 -p S3_vs_S4 Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR Loading required package: limma [1] "abstra...

问题 基因家族提取用hmmsearch --domtblout result.txt --cut_tc zf-C2H2.hmm Fvesca_226_v1.1.protein.fa 时提示 Failed to open tabular per-dom output file result.txt for writing

我用Bio-Linux-8.0.7.2018.10.31可以运行这一步，但Bio-Linux-8.0.7-2019.3.20这个版本运行出现上的提示，请老师指导

问题 重测问题

我再你们服务器上运行一些重测序命令的时候，例如，for i in $(cat $workdir/data/data.txt); do echo "RUN CMD: fastp --thread 50 --qualified_quality_phred 10 \    --unqualified_percent_limit 50 \    --n_base_limit 10 \    -i $datadir/${i}_1.fastq.gz \    -I $datadir/${...

问题 你好，我是初次接触网络分析绘图，在R中运行以下代码总是报错

...matrix(Abu) table<-Abu table[table>0]<-1 table.generalist<-Abu[which(rowSums(table)>=1),]  Abu<-table.generalist总是出现Error in V<-(*tmp*, value = *vtmp*) : invalid indexing这种报错，我想可能是数据格式的问题，但是具体是什么问题也不知道，能...

文章 预测miRNA前体

...RanFold P值 过滤： /share/work/pipline/sRNA/bin/mirdeep_plant/select_for_randfold.pl signature.arf precursors.str > precursors_for_randfold.ids                                                  /share/work/pipline/sRNA/bin/mirdeep_plant/fastaselect.pl precursors.fa p...

文章 预测miRNA前体

...RanFold P值 过滤： /share/work/pipline/sRNA/bin/mirdeep_plant/select_for_randfold.pl signature.arf precursors.str > precursors_for_randfold.ids                                                  /share/work/pipline/sRNA/bin/mirdeep_plant/fastaselect.pl precursors.fa p...