文章 csvtk，A powerful software for handling CSV files

CSVTK，即CSV工具包，是一个用于处理逗号分隔值（CSV）文件的实用命令行程序。由于其简单性、灵活性和效率，对于经常处理CSV文件的人来说，特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的领域，CSVTK都是一种非常有...

文章 TCGA挖掘高分文章

WGCNA+免疫浸润 ：An Immune-Related Gene Prognostic Index for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma. 文章标题:Clinical significance and immunogenomic landscape analyses of the immune cell signature based prognostic model for patients with breast cancer 文章标题:   Immune cell infi...

问题 ANNOVAR变异注释报错：Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...system command <convert2annovar.pl  -includeinfo -allsample -withfreq -format vcf4 /work/bdorsalis/4.snp_indel/var_qc/all.clean.snp.vcf.gz > /work/bdorsalis/5.var_ann/test/snp.avinput> NOTICE: Finished reading 840 lines from VCF file NOTICE: A total of 224 locus in VCF file passed QC thr...

文章 百度网盘 for Linux ——BaiduPCS-Go用法

常使用linux，但仍然需要百度网盘和外界进行沟通的用户一定知道bypy，不过遗憾的是，这个软件python写的软件太过缓慢，不过我最近发现了一个软件，BaiduPCS-Go 他用go编写，几乎像是百度网盘linux版一样好用 在官网找自己服务...

问题 老师，请问，用Evolview美化进化树时，在添加background colors for leaf labels，提示error: error: at least one valid colorset data should be given; data not upload/ updated是什么原因呢

文章 科研小白：生物实验做不出来是种什么体验？

...oxin stimulates factor VIII secretion from endothelial cells. Implications for hypercoagulability in cirrhosis 期刊：Journal of Hepatology IF：12.486 产品名称：RAB27A Polyclonal Antibody 标题：The arginine methyltransferase CARM1 represses p300•ACT•CREMτ activity and is requir...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

...docker软件的containers中出现 request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports the requested API version

文章 samtools之index

...ls index <in.bam> [out.index] Options:    -b    Generate BAI-format index for BAM files[default]    samtools index -b xx.bam  建立索引后将产生后缀为.bai的文件    -c    Generate CSI-format index for BAM files    samtools index -c xx.bam  建立索引后...

文章 read.table参数

...("allow.loss", "warn.loss", "no.loss"), row.names, col.names, as.is = !stringsAsFactors, na.strings = "NA", colClasses = NA, nrows = -1, skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip, strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE, comment.cha...

问题 老师您好！我把顺势作用元件的名称都改成了大写的，但是出现了如下报错Request-URI Too Long The requested URL's length exceeds the capacity limit for this server.

老师您好！我把顺势作用元件的名称都改成了大写的，但是出现了如下报错然后根据提示更改设置，但是“具体参考”链接一直打不开还了几台电脑都不行，希望老师指点

文章 perl 多线程

...n()，收割已经创建的线程；             threads->list(threads::all)，返回所有已经创建的线程；             threads->is_joinable()，返回目标线程是否已经完成，等待join；             其他的在perldoc上了，字母文...

文章 Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么？

...换方法1、打开uniprot网站，https://www.uniprot.org；2、点击“Retrieve/ID mapping”，跳转页面进入ID转换界面；3、上传ID列表，选择转换类型，进行转换；4、查看并下载转换后的数据。BioDBnet基因ID/名称转换方法1、打开网站https://biodbnet-a...

问题 全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

...错为： java.lang.IllegalArgumentException: Sample Line68 has an inconsistent number of alleles. The first genotype is diploid, but the genotype at position Chr2:35902177 is haploid

问题 老师你好，我在qiime2分析数据的过程中在进行第二步生成特征标和代表序列时输出的文件在可视化指令执行后，就提示该qza文件is not a QIIME 2 Artifact (.qza)，无法进行可视化分析，直接进行下一步物种分类时输入文件也存在相似问题，这几步在第一次分析时都没有问题，只是当时进行第三步分析时内存爆满，后重装c盘再次重新运行时出现了这些问题

文章 SCP FeatureDimPlot 报错

...sg, call)) : error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 't': error in evaluating the argument 'x' in selecting a method for function 'as.matrix': no slot of name "data" for this object of class "Assay5" 由于SCP Seurat V5 支持不好,我们把V5的seurat文件...