... 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂...
GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入： IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践：https://www.omicsclass.com/article/1673 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践： https://www.omicsclass.com/article/1677 BCC 基底细胞癌（GSE123813 count表...
...ct -FixedEffectLMPlugin \ -endPlugin -export hd_GLM_structure 是否可以通过在这条命令中添加什么参数，让它不过滤indel，同时计算indel的p值呢？
...main ="expression", las =2）得到上图结果，通过加入outline= F，可以纠正错误。 但是我数据整理后，进行密度分布图的时候， 出现上图的问题， 不是很熟悉ggplot2，不知道代码哪里进行修改。 P_density_GeneID = ggplot(datExp,aes(x=Exp))+geom...
...i 指定基因组fasta文件，-bed 指定要提取序列的位置文件，可以是bed、gff 或 vcf 文件（染色体碱基位置从0开始计数）。 -tab 指定输出格式。 $bedtools getfasta -fi GCA_001651475.1_Ler_Assembly_genomic.fna -bed id.bed>CM004359.1:0-10gtttagggtt>CM0043...
...大，使用perl等编程语言处理会非常慢，而且容易出错。 可以使用Linux 中的paste和awk处理： 命令如下： paste file1.txt file2.txt | awk 'BEGIN {OFS="\t"} {print $1, $2, $3, $4 + $11, $5 + $12, $6, $7}' > result.txt 使用paste命令将两个文件合并，再...
望老师同学能指点下，卡在了这里，纠结死了，如觉得描述不清楚，可以评论细问 输入的文件有按照前面产生的id文件和下载注释文件，注释文件倒是与拟南芥的有些不同吧
...续的分析有很大的影响吗？具体影响是什么？或者为什么可以取不那么极端的性状，却对后续分析没有很大的影响? 谢谢老师，希望您能回答一下我的疑问。
...道微生物组成及其利用甘油/1,2-PD和产生钴胺素的潜力。可以得出结论，pduC/pduCDE的丰度可以用作生物标记物，预测复杂微生物群落中借助Pdu活性对甘油或1,2-丙二醇的利用潜力
...https://api.github.com/repos/icbi-lab/immunedeconv/tarball/HEAD' failed 可以用Rstudio安装包： 以管理员身份打开Rstudio： 然后在终端依次运行： 以下代码： #设置镜像，local({r <- getOption("repos") r["CRAN"] <- "https://mirrors.tuna.t...
使用HiC-Pro和EndHiC软件可以实现以下HIC热图绘制。 一.运行HiC-Pro 文件准备： 1.准备index文件 bowtie2-build genome.final.fa genome.final 2.准备annotation文件 要有两个： 第一个是bed文件，通过软件包里面HiC-Pro-3.1.0/bin/utils/digest_genome.p...
...能是版本更新，参数有改动。将--noPS参数改为-noPS之后就可以正常输出文件了。
... xlwt & xlutils 、 XlsxWriter 、 OpenPyXL ，而在 Windows 平台上可以直接调用 Microsoft Excel 的开放接口，这些都是比较常用的工具，还有其他一些优秀的工具这里就不一一介绍，接下来我们通过一个表格展示各工具之间的特点： 以上...
...业-学历”命名，发送附件简历的同时请将简历直接粘贴到邮件正文中，以便查看。 咨询电话: 010-80543251；18510861411
...lor="#B53E2B"))) 绘图如下： 好了，小编就先给大家介绍到这里。希望对您的科研能有所帮助！祝您工作生活顺心快乐！