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文章 IF=3.47|非肿瘤-眼部老年黄斑变性ceRNA文章思路

...大多数受影响的患者还没有特效的治疗方法。 文章: 分析思路: 数据介绍: 来自GEO两个表达数据,包括AMD患者和正常对照:    主要结果: 1.两个数据集,分别以患者和对照为分组筛选差异基因: 2. 共有的差异表达基...

问题 关于mirna预测靶基因数据库的下

各位老师好,我现在准备下mirna预测靶基因的数据库targetscan,但是知道该下哪个文件,请老师解答一下。

文章 GEO数据库的搜索下数据技巧

... 另外一种就是通过NCBI主页的入口基因搜索下。通常是知道GEO编号,通过样品类型,实验处理,平台信息等搜索筛选想要的GEO数据:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,进入NCBI主页,搜索数据选择GEO DataSets,如果搜索某个基因表达量可...

文章 vt软件安装

...at> >&)::<anonymous struct>&)’ 这是因为你的gcc版本太低,最低要求4.8.1,更换较高版本: export PATH=/share/work/biosoft/gcc/gcc-v4.8.0/bin/:$PATH 报错3: g++ -pipe -std=c++0x -O3 -I./lib -I. -I./lib/htslib -I./lib/Rmath -I./lib/pcre2 -I/share/work/...

问题 MCScan画图每条染色体同颜色

求助 我想最后生成每条染色体颜色都相同的MCScan图,我的layout文件应该怎么设置啊????? 类似这样

文章 构建遗传图谱---作图群体如何选择?

...亲本时应尽量选用纯度高的材料作为亲本,如果材料纯度够,可以通过自交进一步纯化; 4、杂交后代的可育性:杂交后代可育性低会影响分离群体的构建,会导致严重的偏分离现象,降低图谱的准确性。 分离群体类型 根...

文章 进化树+基因表达热图二合一靓图绘制教程

...图,中层是基因ID,里层为拟南芥基因之间的进化关系,仅直观地展现了物种的进化发育系统,还把每个基因的表达量信息也展现出来,是是很漂亮!今天我就教大家绘制上面这个图,让你的图成为进化树中最靓的仔! 1. ...

文章 疫情当下,“云办公”在国外会面临什么样的问题和挑战

...。 但是国外的疫情,看上去正在重蹈我们之前的路。断飙升的确诊人数,让原本对“病毒”漠关心的老外,也重视起来。 23号,随着美国确诊病例数量已经快速攀升到全球第三,特朗普再度发表声明,华盛顿成...

问题 老师你好,我是在NCBI上面下的枣的gff,以及蛋白质序列,做共线性分析的时候,perl get_gene_position.pl GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_genomic.gff AT.gff输出之后的文件与perl get_fa_by_id.pl AT1.gff GCF_000826755.1_ZizJuj_1.1_protein.faa pep.fa输出的文件是空的,应该怎么办。

文章 简述一代、二代、三代测序技术在应用上的区别

...NA测序,DNA甲基化测序,高密度遗传图谱,大规模GWAS关联分析等等实验手段得到了广泛的推广应用。 对其测序原理有兴趣的同学可以点击观看官方视,我们组学大讲堂制作了中文字幕方便观看。 二代测序技术虽然通量很高...

问题 基因家族启动子顺势作用元件预测网站plantcare对昆虫适用嘛?

...于动物的网站,或者根据植物预测结果如何联系动物进行分析? 此外还想请教一下根据mitof分析结果可以看到在一个基因位置基因id:9852 发生了2个拷贝,这种情况需要把这个基因拆成2个吗?9852在基因组注释结果里是1个基因,...

问题 芯片探针解读

...ol是这样子的XLOC_l2_007835,XLOC_l2_015212这些是什么东西?也知道它是是基因,可可以把它去掉?还有gene sybmol里面有些lincRNA是这样子的lnc-RP11-778D12.2.1-5 这样的拼写是对的吗?

文章 linux命令之mv

...文件移至一个目标目录中。源文件被移至目标文件有两种同的结果:如果目标文件是到某一目录文件的路径,源文件会被移到此目录下,且文件名变。如果目标文件是目录文件,则源文件名(只能有一个)会变为此目标文...

问题 情况是这样,去年我测了一个转录组,当时我做的物种还没测全基因组,也就是当时是无参的情况,今年最近该物种的全基因组数据发布了,我在全基因组中做了一个基因家族的分析,然后想在去年测得转录组中找到全基因组中相对应的基因,然后看其表达量,能否通过简单blast实现?或者有其他更为准确地方法吗?请各位老师赐教。

问题 老师我一个一个步骤进行,一个基因一个基因分析,是这个命令有问题才出现domain_final.bed只有一个基因,代码有问题么:grep -v '#' ZS11.v10.FAE1_hmmerOut.final.txt|awk 'BEGIN{OFS="\t"}$10==1 {print $1,$18,$19 }' >ZS11.v10.domain_final.bed,这是我刚刚使用的这步的代码,前一步产生的hmmerOut.final.txt文件还整常

如果代码没问题,只能手动筛选么,怎么保存成domain_final.bed格式呀