找到约 15 条结果

文章 clustalW命令行批量多序列比对

...1\nWRKY_domain.aln\nWRKY_domain.dnd\nX\n\n\nX\n" |clustalw2 更多生物信息课程: 更多生物信息课程:1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2...

问题 成纤维细胞分好的亚组添加到总的组中

已经 有了一个分好亚组的信息(例如每个 "fib" 细胞已经知道是 "fib1", "fib2", "fib3"),想把这个信息 添加为 metadata 的新列。 metadata 有一列 celltype 你另外有一个向量或列(比如 fib_subtype)记录每个 fib 细胞属于哪一个亚组(fi...

文章 双11优惠火热进行中---生信课程历年最大优惠来袭!

...为专业的生信培训机构 截止到今天,共计发布60+门生物信息视频教程,涵盖基因组分析、群体研究、转录调控、癌症数据库挖掘、微生物研究、生信基础(Linux、Python、R、Perl)等方向,学员数量已超过70000人!多门课程被推送...

问题 perl脚本去除重复的hmmer搜索的转录本ID为一行,且结果ID是蛋白序列ID。

...件。我检查了自己的gff文件,第三列包含了gene,mRNA,cds等信息(标注2)。但是与拟南芥的gff文件相比,多了红色部分内容(标注1)。如图所示: 图一为我的gff文件信息  图二 拟南芥 另外,我检查了蛋白ID和gffID,发现ID不...

文章 FigTree进化树批量修改ID

...nnotations 4、完成导入后,在左侧 Tip Labels栏中将怎加一列信息,例如此处的NewName(即前期文件中对应新ID列的内容) 5、将Tip Labels 显示(Display)选择成你设定的新ID,例如此处选NewName,进化树上叶处的ID将发生改变,如下: ...

文章 UALCAN--TCGA数据挖掘网站

...分析等等,还可以通过相关链接查询其他数据库中的相关信息。总而言之,是一款操作简单、快速有效的TCGA数据挖掘分析的网站工具。 基因整体表达热图 针对研究的癌症项目,可以查看整体的基因表达情况,譬如,通过网页A...

文章 芯片差异分析分组矩阵

利用limma 包进行芯片数据差异分析,需要按照分组信息构建分组矩阵,基于model.matrix函数完成,获得的分组矩阵结构类似下方显示结果: > design           A BGSM1626001 1 0GSM1626002 1 0GSM1626003 1 0GSM1626010 0 1GSM1626011 0 1...

文章 感兴趣的蛋白,如何研究它的结构-Phyre2工具使用介绍

...更完整的模型(full-length model),建模步骤如下图。 更多信息请查阅原文献:https://www.nature.com/articles/nprot.2015.053 Phyre2的使用 Phyre2网址:http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index。 打开Phyre2网址,页面如下,网站无需注册即...

文章 你还在为基因芯片表达差异分析发愁吗?这个方法带你飞!

...家介绍了:如何从GEO数据库下载芯片数据及相关样本处理信息等等(不知道的可以戳这里哦)。这些芯片数据下载下来干嘛呢?下载必然是为了挖数据啦!指不定什么有意思的东西我就发现了呢?指不定老天爷眼睛一闭让我发了...

问题 老师,在做共线性分析的时候,在gff文件中提取出来的基因位置信息和ID号,与蛋白质文件中的ID号不一致,一个为基因号,一个貌似为转录本的号,所以提不出来蛋白序列,这种情况应该怎么办呢?并且有些基因在哪条染色体上也没有研究清楚好像,所以提出来的有些基因的染色体号为0,那如果这样的话还可以往下做共线性分析吗

文章 endnote 如何插入书籍引用

...),就可以方便的把文献插入到自己论文当中,那些作者信息,文章题目,杂志名称等信息都可以自动帮我们整理好,非常的方便。 例如: 但是,如果你想引用的参考文献不是普通的文章,而是一本书籍里面的一段,这时...

文章 GEO数据库dataset和profiles区别

...号,后续NCBI中的工作人员会根据研究目的、样品类型等信息归纳整合为一个GDS(Datasets),整理后的数据还会有GEO profile数据,也就是基因在这次实验中的表达数据。GDS里面的数据往往对应相同的平台具有可比性,另外,不是所有...

文章 植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

...对引物。用户可获取目标物种有用的微卫星DNA位点和引物信息,以及每个位点所属物种、位置、起止、类型、大小以及序列信息。用户可以利用数据库进行微卫星DNA位点在线鉴定及分子标记在线设计。该数据库还提供了多种检索...

文章 linux 硬盘分区 格式化 挂载

...个物理扇区中的64个字节作为分区表的空间保存硬盘分区信息,每个分区的信息要占16个字节。所以,MBR分区表最多只能保存4个分区的分区信息。2、MBR分区方案中,有三种类型的分区,主分区、扩展分区和逻辑分区。扩展分区与...

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

...: 测试数据表格下载:qRT-PCR_demo_data.xlsx 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...