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文章 图片去除大块黑色区域

在使用MEGAN软件绘制分类学树状图时，如果物种较少，生成的图片会有大片的黑色区域，很不美观。那怎样去除呢，请看下面脚本： 脚本运行命令： python /share/work/wangq/script/work/png_black.py -i /share/nas1/fanyc/project/zx-20171030-47_21_ITS/2...

文章 IF=29|苔藓植物的超泛基因组分析

...持续来源，近 70% HGT 家族属附属或独特类型，或因生殖系细胞易接触微生物。 文献来源：https://doi.org/10.1038/s41588-025-02325-9 更多生信课程：

文章 饼图中添加文字的位置控制-ggplot2（非公式）

前面给大家讲过怎么去画饼图 https://www.omicsclass.com/article/376  也讲过堆叠柱状图 https://www.omicsclass.com/article/369  pie图讲解主要是针对图片中文字的添加位置公式进行了解释，这里结合堆叠柱状图内容 介绍不利用公式，而利用ge...

问题 你好老师，在基因家族比较时候，准备bed文件和CDS文件问题

...FF 文件里搜索 可能是这没gene原因，这个也没什么用，该怎么避免这个报错，或者跳过呢 谢谢老师啦！

文章 群体进化和GWAS文章没那么难发！

...里，可能会有人说“小编你就忽悠吧！NG的文章在分析上怎么可能没有花？”，对于这种情况，请看原文！ 总结： 总结一下，群体进化和GWAS关联分析的文章在数据分析方法上并不难，关键在于材料的选择和性状数据的调查。...

问题 Linux服务器上安装R之后，在R环境下利用githubinstall安装QTLseqr出现问题，如何解决

利用githubinstall 安装github上的QTLseqr（老师介绍的），出现如下错误，应该怎么办呢

问题 基因家族分析 基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系

....chr0.533 ONI03914 ONI03980是可以搜到的，，，请教老师，这个怎么改才能出图啊，以下是我TAO和FN文件的截图：

问题 PASA Can't drop database

...的这个解决办法外 https://www.omicsclass.com/question/4978  还能怎么解决

问题 利用脚本[get data by id]时出现报错

在利用脚本[get data by id的时候出现如上报错应该怎么解决？ 代码如下： manager@bl8vbox[sharelecture4]  perl /home/manager/sharelecture4/script/get_data_by_id.pl pep_ID.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa >nbspep.fa Died at /home/manager/sharelecture4/script/get_...

文章 老师您好，请问在群体遗传进化中，模板数据黄瓜的分组，sample 是指的什么？是测序数据下机的样品编号？

不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？

问题 MEGA构建系统发育树时总是报错 No common sites found

...后才能构建进化树，请问下这种情况为什么会出现，应该怎么解决

问题 重测序

一行一个任务是什么意思？下面的这个命令，怎么改可以并行运行？ ###################################################3 #GATK call SNP #################################################### cd $workdir  #回到工作目录 mkdir -p $workdir/4.snp_indel/GATK cd $workdir/4...

问题 重测序分析，bam去重复，建立索引后，call SNP之前的步骤

...生成新的bam，在进行call SNP 目前不知道GATK 的call SNP前怎么处理了，问题叙述如上，麻烦老师请解答

文章 Linux qr命令生成二维码

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...

文章 WGCNA知识点详解-提升你的转录组论文档次

...复就要按照3个重复来进行分析。 10、进行WGCNA分析时，怎么对所选用的基因进行过滤？ 一般来说，我们会把表达量较低，且在各个样本中变化不大的基因过滤掉。 以上即是小编整理想一些WGCNA分析的基础知识点。如果您需要...