基因家族分析 基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系


老师您好,我在跟着视频学习基因家族分析,做到基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系这一步最后画图时,现如下问题:

attachments-2023-01-ejB5RI4663b5280cdee45.png

我一共做了5个物种的比较,以下是我的文件内容截图:

attachments-2023-01-3VPS3hQw63b52847b2f28.png


attachments-2023-01-YKwvoIzL63b5286b83623.png

我看主要是TAO和FN的基因在bed文件里找不到,,但是我在bed文件手动搜索报错的第一对:evm.model.chr0.498 evm.model.chr0.533 ONI03914 ONI03980是可以搜到的,,,请教老师,这个怎么改才能出图啊,以下是我TAO和FN文件的截图:


attachments-2023-01-M39GLXOV63b5289b3ff9f.png


attachments-2023-01-uiyw9gZf63b528b0c5826.png








请先 登录 后评论

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

把ID简化一下吧,python 版本的mcscan,ID中有点会不识别

请先 登录 后评论
小夭

好的我试试  谢谢老师

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,815 浏览
  • 小夭 提出于 2023-01-04 15:23

相似问题