问题 转录组与转录组之间所有序列进行两两比对

...1000条序列，对应到2中相似性最优的序列也有1000条。这样可以实现吗，如果可以，我们可以详细聊一聊。

问题 请教下，我现在装了几个计算节点，我用管理节点切换到计算节点后，环境变量都变了，怎样使把管理节点账户的环境也能同步过去呢

问题 三代转录组中，想找A蛋白的同源序列，blast比对到的序列有很多，这些同源序列就是这个蛋白家族的所有序列吗？

无参物种，三代转录组中，想找A蛋白的同源序列，blast比对到的序列有很多，这些同源序列就是这个蛋白家族的所有序列吗？还是再需要其他方式鉴定下？

文章 从Windows粘贴到linux的内容行尾会有东西？

...所以两个chr01就不相同了。其中具体原因并不清楚，但是可以有间接的解决方案（最根本的解决方法等以后清楚后再来更新。），就是在输入文件的最后加一列，如： chr01    1chr02    1chr03    1chr04    1chr05    1chr06  ...

文章 科研小白：生物实验做不出来是种什么体验？

关于这个问题， 学霸姐姐的某个师弟表示： 我连自己做出来过的实验都重复不出来，而且连续一个月都没做出来，你觉得我是什么感受? 人生已经如此艰难， 而我们生物汪的人生，往往是难上加难。 生物实验有多难做我...

文章 镜像加速（Docker Toolbox）与挂载数据到到虚拟机

...定分配2.重启之后就有/d 然后你就可以在虚拟机中看到 /d 这个目录，目录中的文件也就是 windows系统中 D:\ 中的文件，挂在文件进docker 虚拟机：#重启 docker-machine restart default  #下载镜像 docker pull omicsclass/blast-plus #运行镜像，...

文章 网络概念以及Cytoscape导入数据格式理解（ceRNA等多元关系网络数据）

...以及这两个对象存在关系（连线），我们只需要告诉软件这个信息就可以了。譬如在整个网络里面A 和B 是关联的（下图），我们就要提交一个数据告诉软件A和B在网络图片里面应该有一条连线。 所以我们会整理出一个最基本...

问题 老师，你好，我下载的这个文件的链接为什么不是.sra格式的，现在用迅雷的下载命令也下载不下来

文章 科研汪专属花式表情包，不懂不是科研人！

...讨厌听到的话 最直击最灵魂的一句提问就是：“你的这个研究有什么用”。 轻轻一拳却打的你满眼金星，瞬间吃瘪。 4、托朋友代购的东东 谁曾经没有一头浓密的秀发呢？ 如果可以用一个方程式来解释科研汪们所从事的...

问题 用什么方法标记基因，可以检测到基因产物

文章 蛋白定量-Maxquant软件输出结果说明

...mbined文件夹包含了搜库结果，如果是DIA建库，导入的即是这个文件夹。其中proc文件夹下的#runningTimes.txt文件，记录了每一步运行的时间。 3.蛋白质鉴定和定量的全部结果都位于txt文件夹下。 其中msms.txt、peptides.txt、proteinGroups.tx...

问题 磷酸转运蛋白家族（PHT1）在Pfam上关键字搜不到pfam 号，在文章中也没有提到，请问这个家族有隐马尔可夫模型么？

用NCBI搜索PHT1，有一个保守结构域，但是这个保守结构域其他基因家族也有，不是特异的

问题 课程里使用bracken对kraken结果进行修饰我发现全部都注释到种水平了这个是bracken算法的设置原因吗？

全部注释到种是不是过度注释了

问题 在PAV分析绘制热图的时候，运行R脚本出现如下错误，请问怎么解决？这个aplot安装包安装也一直安装不了

文章 cBioportal使用教程

cBioportal这个网站，促进多维度癌症基因集数据的探索，可以允许跨gene，样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式，并比较点多癌症研究中gene改变频率，或者在一个个体肿瘤样本中...