这里R语言源代码，有兴趣的可以研究看看 ####################################Arg<-commandArgs(TRUE)###########input###############################################individual_analysis<- c(Arg[1])reprication<-c(Arg[2])filter_value<-c(Arg[3])population_structure<-c(Arg[4])...
...的包管理器安装或更新PCRE库。例如，在基于Debian的系统中，可以使用以下命令： sudo apt-get update sudo apt-get install libpcre2-8 在基于Red Hat的系统中，可以使用以下命令： sudo yum update sudo yum install pcre2 2.如果你已经安装了PCRE库，...
...Excel包含信息如下：期刊名称、期刊名缩写、影响因子、中科... 总有同学咨询基因家族分析类文章可以投哪些期刊，闲暇之余，小编就整理了一下接收过基因家族分析类文章的期刊，供您投稿时参考！此Excel包含信息如下：期刊...
上次的问题不太明确，这次重新提问一下，谢谢各位老师！ 读入cucumberprotein.fasta文件，创建一个id和序列对应的hash, 遍历该hash，并输出到一个新创建的文件中
我在做重测序分析中的call SNP， 我发现一个山羊的测序数据call snp 运行了两天还没有结束，是不是我给的内存太小了，我的服务器的内存是128G， 我给了100G， 是不是太小，请问给多大合适，需不需要加大内存？
当你使用 wget，发送请求时有一行显示HTTP request sent, awaiting response... 302 Object moved然后直接重定向到网站的首页，下下来的就是网站首页的页面了。 所以在服务器端确实有限制，所以我们需要在 http 请求头上做点手脚，来模仿浏...
...转录组，当多个样本进行常规的分析之后需要将多个样品中的转录本合并成一套unigene, 这个可以采用Cupcake 中的“chain_samples.py” 这个脚本来分析。该脚本的运行命令如下： usage: chain_samples.py [-h] [--fuzzy_junction FUZZY_JUNCTION] ...
我用的是转录本ID 不知道这个软件是不是不能用转录本ID ，但是我转换成gene ID 也不行，请老师给建议 难道是由于染色体数量多于拟南芥所以这里也要改吗？ 老师还请您指导
我要做Gwas分析，需要生成hapmap文件，但是我直接用vcf转hapmap会报错Please first use SortGenotypeFilePlugin to correctly order the file.所以我就用tassel去排序然后可以正常生成hapmap文件了，但是我的两条比较小的contig不见了
老师您好！请问下图1中红方框中的碱基序列长度修改是否可以根据文件“2.fastqc”中的“multiqc_report.html”中图2的bp平均值进行相应修改，如果可以，那么修改原则是什么，是数据集中的波峰前取值还是波峰中间取值，比如图2波...
...GO，KEGG注释和富集情况。 我在《转录组数据分析》课程中推荐大家采用clusterProfiler。这个软件目前能支持20种模式物种的注释，但其实不止这些，软件的作者也给出了，针对非模式物种的一些解决方案。 参考这个方案，我们看...
在转录数据进行可变剪切分析中，经常用到一款软件rMATS，这是华人科学家刑毅课题组开发的软件， 最近该软件发表了一个能支持pacbio 数据的版本lr2rmats，结合二代和三代数据，进行可变剪切分析。 1. lr2rmats的安装 ： 安装...
...际化的科研氛围。本课题组依托海峡联合研究院代谢组学中心、农林大数据中心，以及国家菌草工程技术中心科研平台开展工作。 课题组介绍： 转录系统生物学实验室（Transysbio Lab）的研究目标是——探索表观基因组特征...
...精度不同，提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中，使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器，可在QIIME2官网下载 https://docs.qiime2.org/2022.8/data-resources/ 方法注释在训练分类器之前，我们要弄清楚三点：1.选择...
老师您好！我用linux的megacc构建进化树，在.mao文件中设置的线程数是最大值40，然而，在运行过程中，一直只是一个线程运行，实在太慢了。请问这是咋回事？