找到约 15 条结果

问题 客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件,但是两者之间有差异,像是缺了几列是怎么回事,如下面详述,请解答

panIDtranstransChrtransStarttransEndtransStrandpanChrpanStartpanEndpanStrandexemplar pan-zea.v1.pan00001Zd00001aa032704_T001Zd-Gigi_PanAnd-1.chr94826216948264952+chr91960330419606076+Zm00001eb376300_T001这是玉米26Pan-genes.list的部分结果。下面的是我自己物种的部分结果 Pangen...

文章 筛选VCF中指定位置变异位点

...这里有简单的方法可以实现。 我们需要用到vcftools这款软件,它是专门处理VCF文件的工具,只需要一条命令就可以完成。 vcftools --vcf Variants.snp.unknown_multianno.vcf --chr A03 --from-bp 577700 --to-bp 607700 --out out_prefix --recode --recode-INFO-all ...

文章 awk基本参数解释

...然后进行相应的操作。 awk读取单个文件时的基本语法格式是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{print $0, $1;}' filename 读取多个文件时的语法是 awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}ARGIND==1{print $0, $1;}ARGIND==2{}' file1 file2 awk后面的命令部分是用引号括起来的,可...

问题 老师,为什么我在网页上处理好了图,把那个线条变成了第二张图所示的,然后一导出,就变成了第一张图那种线条形状的了,有什么方法能正常导出吗老师?另外就是,我的图只能用这种截断的线条,,那我的标尺需要怎么改呢老师?因为他不是要把正标尺改为负标尺吗?

另外就是,我的图只能用这种截断的线条,,那我的标尺需要怎么改呢老师?因为他不是要把正标尺改为负标尺嘛

问题 微生物多样性分析课程镜像ampliseq-q2运行出错:there is no package called ‘BiocManager’

... more. Debug info has been saved to /tmp/qiime2-q2cli-err-u8wvbzh9.log 打开日志文件: Error in library(BiocManager, quietly = TRUE) : there is no package called ‘BiocManager’ Calls: .First -> library Execution halted 问题: 是不是缺少BiocManager这个包?是镜像...

问题 不同胁迫处理以及不同类型的RNAseq数据denovo组装

...哪一个好?数据类型不一样能放在一起组装么? 用什么软件会更好一点处理这个问题? 谢谢老师,期待您的回复解答。

问题 老师您帮忙看一下 就是我在做cafe分析的时候 这个我删掉一个 他又出来一个 这个怎么一次性删除啊 这个他不是一次性出现所有的基因 而是找到一个他就退出来了,我也看啦您在上面的回答 按照那个方法来还是一样的解决不了

问题 序列上传

老师您好,我想问一下我在Biosample 填写样品Attributes的之后,总是说我样品名出错,用数字1.2.3,或者字母A/B/C/D...都不行,应该怎么改啊应该怎么改啊,谢谢老师

文章 Rush:一款强大的Linux并行任务执行工具

...批处理任务。该工具的设计初衷是为了使并行处理和任务管理变得更为简洁明了,同时具备灵活性和高效性。 Rush的工作方式是通过提供一个输入列表(例如文件列表,命令列表等)和一个命令模板,然后根据命令模板生成并行...

问题 更改文件及perl脚本后get_gene_weizhi.pl提取文本依旧为空。

...文本文档依然为空。。。想请问一下是不是我的染色体的格式是chr4.4造成的这种原因呢,还是其他什么问题。麻烦老师再次解答~ 老师,文件及路径我都核对过,没有问题:

问题 老师,请问蛋白质组学差异蛋白的富集分析是用原文件中的基因ID还是蛋白ID呢,如果用的是蛋白ID,那蛋白注释库是怎么获取的呢?我只做过RNAseq的富集分析,不知和蛋白组富集分析有什么差别。先谢谢老师!

问题 老师您好!我想问下当我在计算群体间遗传分化指数(Fst)时,发现其中两个品种间的Fst值很大,但是群体结构分析中(PCA,NJ-Tree,最大似然树)中却发现这两个品种聚类较近,且在一个分支上。这应该怎么解释啊?谢谢老师!

问题 java环境配置

请问我在做java配置环境变量的时候点击path之后再点击编辑出现以下的界面,请问怎么接下来怎么做? 这与视频上不一样,谢谢!

文章 fastqc质控报告查看

...要对下机的原始测序数据进行质控。通常我们会使用FASTQC软件对测序数据进行质控。fastqC会生成一个html的结果报告,下面是软件对质控结果进行判断:绿色代表PASS;黄色代表WARN;红色代表FAIL(当出现黄色时说明需要查看结果...

问题 老师我想请问比较基因组的问题,我做出来了基因家族扩展收缩的问题,根据课程学习内容,我能提炼出我要研究物种的基因了,但是遇到了一个问题是,假如我想提取一类,比如头足类,该怎么把头足类的所有基因扩展收缩提出来。

比如研究长蛸,和长蛸分在一枝的都是头足类,我就看看头足类的扩展收缩基因