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文章 天天加班,为什么团队研发效能还是那么低?

...定改变方向,最终花了几个月时间可能整个项目没有任何结果或只有半成品。 这样的研发方式:传统研发模式 第二种: 团队项目进入到1.0后的版本,项目团队以产品线为中心,将产品经理所匹配的前端、后台、安卓、IOS等...

文章 clusterProfiler模式物种的GO与KEGG功能富集与注释

...44 简单总结clusterProfiler包进行GO、KEGG的富集分析方法,结果输出及内置的图形展示。 #安装富集分析需要的包if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))  install.packages("BiocManager")BiocManager::install("enrichplot")BiocManager::install("GSEABase...

文章 ELISA实验做不好怎么办?QuicKey ELISA试剂盒来帮你!

...,加入50μL终止液。 6,立即在450nm波长处测量OD值,计算结果。 传统ELISA和QuicKey ELISA对比: 典型数据: QuicKey Human MAU(Microalbuminuria) ELISA Kit 中文名:QuicKey-人尿微量白蛋白(MAU)酶联免疫吸附测定试剂盒 产品货号:E-TSEL-H0005 ...

文章 大数据分析 Hbase Shell命令

...38:0> put 'test','row1','cf1:age','19' Took 0.0059 seconds 查看更新结果 hbase(main):039:0> get 'test','row1','cf1:age' COLUMN CELL cf1:age timestamp=1581130589721, value=19 1 row...

文章 ceRNA网络构建

...获得 。将得到的circRNA-miRNA、lncRNA-miRNA、miRNA-mRNA三种互作结果绘制出网络图。并将circRNA、lncRNA、miRNA、mRNA标注不同颜色。 如图:

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

...uster \ --vars.to.regress nUMI percent_mito --high.variable.genes 2000 结果

问题 KNN补值函数knnImputation函数的距离计算问题

...为什么此处是计算特征间距离进行缺失值填补?两者填补结果都合理吗? function (data, k = 10, scale = TRUE, meth = "weighAvg", distData = NULL) { n <- nrow(data) if (!is.null(distData)) { distInit <- n + 1 data <- rbind(data, distDat...

文章 食管癌 10X多样本(GSE145370)

... mkdir $b;tar zxvf ${a}_${b}_filtered_feature_bc_matrix.tar.gz -C $b;done 结果目录: 循环读入数据做质控: cat map.txt|grep -v "#"|while read a b c d e f g;do Rscript $scripts/seurat_sc_qc.r --data.dir $b/filtered_feature_bc_matrix --project GSE145370 \ --nUMI.min 5...

文章 项目管理软件的应用现状与发展趋势

...难度。 下图是百度指数中【管理软件】关键词近九年的搜索情况,其中2011年下半年和2015年上半年是需求高峰期,今年七月份有个小高峰,其他时间段基本处于平稳期。由此可以看出项目管理工具还是很有市场的。 总的...

文章 高分文章1

...最高影响因子期刊Ca-cancer J Clin (IF=292)在2018年的报告中显示,在中国因癌症死亡的人数排名第二,而今年已经跃居第一,癌症正威胁着国民健康,正因如此针对肿瘤的科学研究热度也逐年上升,小编盘点了一下2020年国际顶级学...

文章 10X Visium空间转录组图像

...能会被过度下采样。如果这类图像的基准定位或组织检测结果不符合预期,10x建议裁剪图像以去除基准边界之外的多余图像区域。过高或过宽的图像可以使用如ImageJ/Fiji等免费工具轻松裁剪。 错误示范: 太宽: 太长: 正...

文章 GWAS模型介绍

...GLM:直接将基因型x和表型y做回归拟合。也可以加入群体结果控制假阳性。 混合线性模型MLM:GLM模型中,如果两个表型差异很大,但群体本身还含有其他的遗传差异(如地域等),则那些与该表型无关的遗传差异也会影响到相...

文章 三代数据SV检测软件安装与使用——cuteSV

...SV文件,分析目录(该目录主要用于保存中间文件,生成结果后软件会自动删除)。cuteSV <sorted.bam> <reference.fa> <output.vcf> <work_dir>其他参数对于一般分析人员而言,使用默认参数即可。运行命令如下(以CLR数据为...

问题 老师,我利用脚本得到对应基因的蛋白序列: perl script/get_fa_by_id.pl WRKY_removed_redundant_IDlist.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pe p.all.fa WRKY_pep_need_to_confirm.fa 时,程序出现错误。 ,这是怎么回事啊?

这是输出的结果 这是脚本

文章 enrichGO_pip.r GO富集分析

...1_vs_S2 --pvalueCutoff 0.5 --ann.db org.Hs.eg.db  \    --idtype SYMBOL 结果展示: 生物学过程(biological process, BP)、分子功能(molecular function, MF)和细胞组分(cellular component, CC) 参考文献: Yu G, Wang L, Han Y, He Q (2012). “clusterProfiler: ...