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文章 mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

.../lib64/libncurses.so.6.2/usr/lib64/libncursesw.so.6.2 从上面的查询结果中可以看到，我现在使用的系统中并没有安装对应5版本的库文件，这个时候可以将高版本创建软连接到5版本。 [root@server bin]# ln -s /usr/lib64/libncurses.so.6 /usr/lib64/libncu...

文章 桑基图绘制

...el(stat = "stratum", aes(label = after_stat(stratum))) +#添加标签，以显示各个节点的名称或标签，如果是text的话就没有外边框和底色了  scale_x_discrete(limits = c("Species", "Class","Price")) +#规定横坐标位置  scale_fill_brewer(type = "qual", palette = "Set3") ...

文章 使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

...# 替换染色体名称sed 's/^0/Chr01/'  Chr01.out.xpclr.txt 得到的结果文件中，每一列分别代表 chr# grid# #ofSNPs_in_window physical_pos genetic_pos XPCLR_score max_s，XPCLR_score 是算出的 XP-CLR 分数。

文章 ppi_network.r 蛋白互作网络分析

...scriptdir/ppi_network.r -g ../04.deg/S1_vs_S2.DEG.final.tsv -p S1_vs_S2 结果展示： 参考文献： Damian Szklarczyk, Annika L Gable, David Lyon, Alexander Junge, Stefan Wyder, Jaime Huerta-Cepas, Milan Simonovic, Nadezhda T Doncheva, John H Morris, Peer Bork, Lars J Jensen, Christ...

文章 nomogram_multi_cox.r 多因素cox分析构建模型并绘制列线图nomogram

...age       -o multicox.nomogram\  -p  multicox   -P 365 710 1095 结果展示： 脚本获取与使用课程：https://study.163.com/course/introduction/1211864801.htm?share=1&shareId=1030291076

文章 linux中 利用rename 批量重命名文件 批量文件改名字

...版本用法上有所区别： 区分方法: rename --version 如果返回结果中包含 util-linux , 说明是 C 语言版本, 反之是 Perl 版本 区别： C语言版本, 支持通配符[常用通配符说明]? 表示一个任意字符* 表示一个或一串任意字符[charset] 可...

文章 做基因定位？大家可能忽略了这个最熟悉的技术

...析，在A03染色体上关联到一个4M的区域。  检阅下BSR的结果是不是靠谱？          在4M的关联区域，查找与抗病相关的功能基因，找到4个TIR-NBS-LRR家族的抗病基因。将这4个抗病基因上的突变位点按照同义突变和非同义突...

文章 从gff文件当中提取对应转录本ID的基因结构信息用于GSDS绘制结构图脚本更新

...xt -in2 Arabidopsis_thaliana.TAIR10.31.gff3 -out gene_exon_info.gff 输出结果（部分）： 脚本源代码： use Getopt::Long; my %opts; use Data::Dumper; GetOptions( \%opts, "in1=s", "in2=s", "out=s", "h" ); if ( !defined( $opts{in1} ) || !defined( $opts{in2} ) || !defined( $opts{o...

文章 敏捷开发流程,您缺一个这样的协作平台

...测试环节，最基本的测试用例定义、追溯，测试的执行及结果记录，测试问题的发起及跟踪自然不在话下。而在追求“敏捷”的开发流程中，持续集成及持续部署是必不可少的增效工具，CORNERSTONE提供与各类CI&CD工具及平台接...

文章 immune_box_plot.r 免疫侵润box分布图

...g subtype.hclust  -y NES  \  -G splitviolin  -o immu -n ssgse 绘图结果：

文章 hclust_analysis.r 转录组数据层次聚类分析

...方法： 应该运行两次 #第一次运行不指定K，通过nbclust 结果选择合适的K （亚型）Rscript $scriptdir/hclust_analysis.r -i immu/ssgsea.res.tsv  -o hclust  -M 20 --distance "euclidean"  #再次运行指定最佳K，输出聚类树和分组表格Rscript $scriptdir/hclust...

文章 IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异

...此，全面了解康乃馨对于指导育种方向至关重要。 研究结果 1. 单倍型T2T基因组组装 基因组组装：作者采用‘Baltico’的新鲜叶片进行了4种测序，将ul ONT、HiFi、和Hi-C数据投入到hifiasm这个软件中进行初步的组装。删除细胞器基...

文章 基因家族进化分析 发10分文章

...个例子，例如，重复基因对之一（AtCBL2/AtCBL3）中的 AtCBL2 显示出与 AtCIPK5 和 AtCIPK25 的相互作用能力，这可能导致 两个 CIPK 竞争与一个 CBL 交互并导致不平衡的现象。然而，作者发现AtCIPK25在冷胁迫和渗透胁迫下在根和芽中均显著...

文章 使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

...> PEER_update(model)#开始计算，注意一定要得到一个收敛的结果，如果1000次计算还是不能收敛，需要调整隐藏因子的数量 iteration 0/1000 iteration 1/1000 iteration 2/1000 iteration 3/1000 iteration 4/1000 iteration...

文章 生物视频教程：生物统计和绘图必备的R语言技能

...优秀的绘图功能数据在统计分析之后，最重要的就是要把结果可视化的展示出来，R拥有顶尖的绘图功能，可以绘制非常专业精美的图形，很多顶级杂志当中漂亮的图都是应用R语言绘制的。 想深入学习R语言的往下看 如果您已经...