老师好,在基因家族分析circos制图时,老师的文件是拟南芥的5条染色体,我的物种有9条染色体,请问这个文件需要怎么修改?

circos最后一步绘图的config2.txt文件,我的染色体是C01开头。图中我已经把拟南芥的1.2.3.4.5改为C01.C02.C03.C04.C05(括号内)。还需要重新添加C06-C09吗?不添加的话,最后结果文件中6-9号染色体都是灰色的,并且没找到我的目标基因id。如果需要,color需要如何填写比较合理,谢谢。

attachments-2019-05-Kn446aRl5ce27b3c8e267.jpg

attachments-2019-05-1pn9olLV5ce27d32bb226.jpg

请先 登录 后评论

1 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

你应该粘贴出你的chr.info文件内容,控制染色体的是这个文件,它标明染色体编号,以及显示的染色体label,染色体颜色等等。

attachments-2019-05-m3Z6ZFZH5ce351ebefabc.jpg


而config文件是调用同时修饰chr.info等其他文件的。 你注意听课程中对于各文件的介绍,不要漏听或者想当然改文件,了解每个文件的格式作用,参数的作用。  具体你仔细参考下文 或者听清原课程:

http://www.omicsclass.com/article/644


相关课程:


基因家族分析实操课程基因家族文献思路解读



请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,184 浏览
  • yupeng 提出于 2019-05-20 18:11

相似问题