...同且纯合,H表示杂合基因型;下图为一个SSR标记的分型结果: SNP标记分型 对于高通量测序的SNP数据我们该如何根据父母本的SNP信息对子代进行分型呢;这里我们看一下下图,其中P1为杂合亲本,另一个亲本P2为纯合亲本;...
老师课中 用到的泛基因列表为上面这张,我根据课程泛基因集构建做出的表为下面这个,为什么格式也不一样呢?另外,课程中用到的结构变异分析结果以及基因表达量数据表格,老师说提前下载的,请问哪里可以下载呢?
...sv --header-key COG_Description -o predictions_cog.txt #KEGG功能预测结果分类汇总 categorize_by_function.py -i predictions_kegg.biom -c "KEGG_Pathways" -l 1 -o predictions_kegg_at_L1.biom categorize_by_function.py -i predictions_kegg.biom -c "KEGG_Pathways" -l 2 -o predictions_kegg_at_...
重新下载了新的bio-linux,导入虚拟机,在终端进行操作,结果win7系统的文本中复制的命令,没法黏贴到bio-linux系统的终端里。不知道是哪里出了问题。求解答。
利用《群体遗传进化课程》提供的原始数据,步骤如PCA,structure等都能重复出结果,但LDdelay绘图时,出不了图。 教程中此步本应该输出更多文件,包括LD绘制图,但是实际只输出了以上3个文件。
...的读取计数总数,然后乘以缩放因子(默认为 10,000)。结果是将每个细胞缩放到总共 10k UMI,以避免样品中不同细胞类型不同测序深度的影响。然后,NormalizeData 添加伪计数 1(以避免转录零值),并获取每个计数的自然日志。...
...build -p 12 --exon ${EXON} --ss ${SPLICE} ${FASTA_File} ${BASE_NAME} 结果如图所示: 最后系统自动kill掉了建索引的进程,请问这该怎么解决?谢谢!
所选的基因组是线粒体基因组测序的结果。
...;}}} 主要就是在一个循环中使用while和each遍历哈希,然而结果总是少了一些数据,后来将哈希改为数组,for循环数组后就没问题了。 网上查询原因才知道用 while 循环 + each 函数遍历哈希表的时候,如果提前跳出了while循环,那...
...,所以在线即可快速完成。具体操作如下。1 输入数据2 结果展示 本次我选用misa格式文件,其格式如下所示 ID SSR nr. SSR type SSR size start end Sd 1 p1 (A)11 11 1549 1559 Sd 2 p5 (ATTTA)3 15 ...
...泛基因家族分析3. 转录组越做越普遍,实验必备,看不懂结果?不会深入分析?自学都可以搞定,学习链接:有参转录组自主分析实操 ;转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ; 4. 代谢组分析硬件要求不高,个人电脑就...
...$10"Parent="$10;}else{print $0}}' PO.gene.gff >PO.gene.gff1 最终结果如下,左边为原始gff文件,右边为更改后的文件,有遇到类似问题的小伙伴可以根据命令来修改一下: 更多AWK命令使用技巧见:linux系统使用 生物信息入门到精通...
以上 2 张图片是我在网上搜索得到的关于 QTL-seq 原理。但是为什么诱变得到的材料,就不能够用 QTL-seq 来分析? 我说获得的 EMS 诱变材料已经是自交 M7 代的材料了,也不能用 QTL-seq 来分析么?因为 Mutmap 方法需要自交,所以感...
...如下,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/操作也简单,直接搜索project ID号,就可以了 然后选择自己想要的直接下载就行 得到的文件直接传给prefetch,类似 prefetch --option-file sra_ids.txt 2,我这边网络不知道咋回事,进刚才那个页...
...化学和物理学领域的大学教授,让他们去评估这份简历,结果发现:无论教授是男是女,他们都更愿意录取名字叫John的男性申请人,而名字叫Jennifer的女性申请人则不被教授们看好,尽管他们都说他们喜欢女性申请者,但给出的...