...mputational gene sets：计算基因集合，通过挖掘癌症相关芯片数据定义的基因集合C5: GO gene sets：Gene Ontology 基因本体论，包括BP（生物学过程biological process，细胞原件cellular component和分子功能molecular function三部分）C6: oncogenic signatures...
...joint calling的方式进行分析，最终会获得单个样本的变异数据。这种文件很难对同组不同样本进行差异SNP分析，此处就需要对文件进行合并。vcf文件的合并有很多的软件可以做，主要的就是GATK、vcftools和bcftools三种，但是具体的合...
... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
老师您好，我想问一下，我做的转录组数据，处理与未处理之间的差异显著的基因，上调基因远远大于下调基因，怎么解释原因呢？谢谢老师
... inches [default 5] 参数说明： -i 包含具有对应关系的数据 Immune_Subtypem6aclustergroupC1C2highC2C1low -g 输入所要绘制桑基图的三列数据的列名 -c 决定分流所填充颜色的列名 使用举例： Rscript script/sankey_plot.r -i /share/nas1/f...
...Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。 在首次使用该工具包中的fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时，出现了如下提示信息： 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –in...
我做的是异源四倍体，我用的GenomeScope1.0 基因组评估（没用2.0），出来的图有两个峰，这是测序数据有污染吗？
老师好，想问下用华大平台测的二代数据，用bwa mem比对到参考基因组上时，-R参数里的tPL后面该写什么？
...式检测及克隆..............................…9910. 植物siRNA测序数据中鉴定病毒siRNA及分析方法...........................11111. 高通量测序鉴定病毒..................................................…12512. 类病毒诱导RNA沉默产生的类病毒特异小RNA分析及...
...esholds based on what the distributions look like for the truth set 评估数据来源：1000Genomes 中的 whole genome trio 基因组重测序数据分析视频课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ或者扫码二维码：
docker中用aspera下载ENA中的数据，提示授权失败，请教原因和解决方法。
数据下载与整理： wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE139nnn/GSE139555/suppl/GSE139555%5Fall%5Fmetadata.txt.gzwget -c "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE139555&format=file" -O GSE139555_RAW.tartar xvf GSE139555_RAW.tarcat map.txt|while read g s p;do m...
.../ampliseq-q1:v1.2 2.生成指定表型的预测文件（运行默认为16S数据） make.user.table.r -i costom_pathway/ 参数说明 -i 准备好指定表型的文件目录 运行成功后，目录下会出一个过程文件intermediates（红色）和需要的指定表行预测文件...
请问老师，同一批处理的数据，16个地理种LNSY.pdf群，只有两个种群的结果正常，其他都是一条直线，检查bam文件也是正常的。这是什么原因呢？
在做重测序中，得到了每个样本的比对率，测序深度，覆盖度。怎样才能合并这些样本，一次可以得到几百份的数据。因为有几百个样本。