...执行合并模拟，使用位点频谱（SFS），推断最适合所观察数据的模型参数。 fastsimcoal2最关键的步骤就是完成自己的配置文件，接下来将会介绍配置文件中需要有哪些信息。 用途： 使用fastsimcoal2模拟基因数据有3种方法： 1. ...
...程日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决：1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做...
已经检查数据全是数字：
这个代码报错我看不懂，请问老师这个要如何解决呀，我用的是自己下载的昂飞芯片数据
...息，而维恩图通常只能粗略估计。 3.UpSetR包绘图 准备的数据文件格式如下： all_deg_id CK_vs_A CK_vs_B CK_vs_C CK_vs_D CK_vs_E ENSRNA049471043 1 1 0 0 1 ENSRNA049471090 1 0 0 0 0 ENSRNA049471102 1 1 0 0 0 ENSRNA049471535 1 0 1 1 0 ENSRNA049473455 ...
对于大批量的数据下载，手动下载无疑是繁琐而又痛苦的，若不巧再碰上网站不稳定，小圆圈转半天就是不出来，此刻的人生必定是绝望的。 对此，小编深有体会，只70多个基因，就用了三四个小时来下载，费时又费力。...
举个例子：从数据库中下载基因组数据，基因组.gff文件中染色体ID较为复杂（第一列） 从全基因组序列.genome.fa文件中找到染色体ID对应简写 想将gff文档中染色体ID全部替换成第二列LC*命名 use Data::Dumper; use Getopt::Long; use strict;...
...mputational gene sets：计算基因集合，通过挖掘癌症相关芯片数据定义的基因集合C5: GO gene sets：Gene Ontology 基因本体论，包括BP（生物学过程biological process，细胞原件cellular component和分子功能molecular function三部分）C6: oncogenic signatures...
课程数据资料提供了一个名为koeken1.py的脚本，运行报错koeken1.py 是否还有其他脚本可以使用？
要不我把数据发给你，你计算一下？或者你再我服务器上计算一下。
...joint calling的方式进行分析，最终会获得单个样本的变异数据。这种文件很难对同组不同样本进行差异SNP分析，此处就需要对文件进行合并。vcf文件的合并有很多的软件可以做，主要的就是GATK、vcftools和bcftools三种，但是具体的合...
... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
... inches [default 5] 参数说明： -i 包含具有对应关系的数据 Immune_Subtypem6aclustergroupC1C2highC2C1low -g 输入所要绘制桑基图的三列数据的列名 -c 决定分流所填充颜色的列名 使用举例： Rscript script/sankey_plot.r -i /share/nas1/f...
...Information) 开发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。 在首次使用该工具包中的fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时，出现了如下提示信息： 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –in...
老师您好，我想问一下，我做的转录组数据，处理与未处理之间的差异显著的基因，上调基因远远大于下调基因，怎么解释原因呢？谢谢老师