...隔的文件使用“\t”quote 引用，指定用于包围字符型数据的字符dec 用来表示小数点的字符,指点小数点数row.names 保存着行名的向量活文件中的一个变量的序号或名字，缺省时行号为1，2，3，…col.names 指定列...
...，但是有几个问题不太明白，想请教您。 1.公司给的测序数据，用得到的差异基因的核苷酸序列去NCBI上找，找不到对应的基因，是因为有可能选择的基因组没有上传到NCBI吗？如果这样的基因比较多，是否需要考虑更换基因组？ ...
视频课程推荐： 重测序数据自主分析：https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ群体遗传进化分析https://bdtcd.xet.tech/s/3QzQFb 重测序大家都不陌生，它是检测样本基因组变异（SNP，indel，SV，CNV）的主要手段之一，有了这些变异信息，后续可以...
...domain位于蛋白质上的终止位置 4.第四列为domain名称 导入数据与设置 如下图所示导入数据。 导入后生成，即可生成图片，TBtools可以自动计算domain在基因上的位置。在基因结构图里会显示出domain的位置信息。
... 日常科研中你我经会常遇到看不懂的图表，不会挖掘的数据，没有思路的文章，沟通不畅的个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，...
...eseq:/work omicsclass/reseq:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像，老用户重新下载示例数据压缩包 课程链接：https://bdtcd.xet.tech/s/1VQOjQ
这个是Leaf-vs-Fruit的数据，这个log2FoldChange是不是Leaf-vs-Fruit的值？有这个值能不能画这个植物某个部位比如说叶的热图，那这个log2FoldChange和FPKM又有什么关系，还是说画某个部位比如说叶的热图要用FPKM，那FPKM这个数据又怎样得来...
...章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...
...份合格的“说明书”应该能够让0基础的同学看懂庞杂的数据结果，知道结果背后的生物学意义，解决“是什么”的问题。 主流测序公司在交付转录组结果时会分成“结题报告”和“结果文件”两部分。其中结题报告（通常是一...
...ne targetshttps://www.nature.com/articles/ng.3538 SMR是一种基于总结数据的孟德尔随机化变体，专门整合eQTL（基因表达定量位点）和GWAS数据，测试特定基因表达水平对复杂性状的因果影响。它高效处理大规模公共数据，优先使用eQTL中最强...
...GSSize两个参数，这两个参数的理解是放入函数里面的基因数据在某条通路上的基因数据买该范围内才回入选做富集分析统计，还是本身某条通路在现在已经记录的库里面的基因数在设置的范围内才会入选进行富集分析？这两个参...
您好，课程的数据demo关于GWAS中的LD衰减分析中的脚本是PopLDdecay -InVCF ../00.filter/all.varFilter.vcf.gz \ -SubPop popid.txt -MaxDist 500 -OutStat ld.stat。然而在群体遗传进化LD衰减分析中的脚本是 PopLDdecay -InVCF $workdir/00.filter/clean.vcf....
...到Gene A上的reads数量：1000 3. 比对所有基因上的reads数据量：1,000,000 4. 样品1中覆盖75%基因的reads数：2000 那么，FPKM和FPKM-UQ的计算结果如下： FPKM = (1,000)*(10^9)/[(3,000)*(1,000,000)] = 333.33 FPKM-UQ = (1,000)*(10^9)/[(...