3 老师,您好,我们是做忙果基因家族分析的,用的是linux(用拟南芥的数据我们都能做出结果),但忙果注释文件gff总是报错,对我们学农的来说,对脚本真是一窍不通啊,根本不知道该怎么修改,老师叫我们把gff文件改成拟南芥的格式,用linux做,我们的基因id,mRNAid,蛋白id都是不一样的,我们想都改成与基因id一致的,我该怎么改啊,老师可以帮忙看看文件吗

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

尝试自己提取序列试试:https://www.omicsclass.com/article/2032

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baby U
agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl  那四个脚本我这边都显示没有,上哪里找这个脚本呢,老师,您看,这是忙果的gff文件,(整个都好乱)[纠结]
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  • baby U 提出于 2023-04-10 21:59

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