找到约 15 条结果

文章 linux shell 将多行文件转换为一行

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

文章 如何鉴定长距离运输的mRNA?

...接接穗和根转录组合并而来的reads进行blastn比对,完美匹配的reads(至少存在2个及以上SNP)再次和重建后的南瓜基因组进行比对,比对上的reads用于后续分析; (3)经过以上多次比对,在步骤2中的再次和南瓜基因组匹配的read...

文章 敏捷开发流程,您缺一个这样的协作平台

...t, 并组织各级需求之间的追溯关系。需求的重用、分支、在线协同编写及在线评审,让团队之间的沟通再无盲区,避免了敏捷开发流程中经常存在的管理失控的问题。 虽然敏捷开发强调文档,但有的时候,您的团队还是...

问题 eclipse当中R插件StatET安装遇到的问题

老师您好,我在eclipse中安装R插件时,遇到了这个黄色感叹号的提示,请问这个怎么处理啊?谢谢

文章 群体遗传进化分析用MEGA

...他很多种分析,例如核苷酸序列和蛋白质序列相互转换,在线blast等等,相关的使用说明可以在MEGA官方网站获得,目前MEGA版本已经更新至7.0,能满足分子遗传进行化绝大部分分析的需求。 小贴士 给出一个小贴士:出现在MEGA...

文章 linux命令之grep

...写(ignore case)。  -v :反过来(invert),只打印没有匹配的,而匹配的反而打印。  -n :显示行号  -w :被匹配的文本只能是单词,而能是单词中的某一部分,如文本中有liker,而我搜寻的只是like,就可以使用-w选...

文章 序列分析软件-DNAman使用介绍(二)

...序列,操作也非常简单,参数设置及结果见下图: 4. 在线Blast比对  DNAman提供快速NCBI比对功能,并提供多种比对形式,如下图: 5. 开放阅读框(ORF)预测  DNAman提供开放阅读框预测,如下图,可展示氨基酸氨基酸数量、...

文章 在线工具TIMER的使用

...e.shinyapps.io/timer/)是用于肿瘤浸润性免疫细胞综合分析在线工具,通过TIMER算法估计六种免疫浸润细胞(B细胞,CD4+T细胞,CD8+T细胞,中性粒细胞,巨噬细胞和树突状细胞)的丰度,其中: Gene 模块探索基因表达 与免疫浸润...

文章 Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么?

...基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称转换方法1、打开uniprot网站,https://www.uniprot.org;2、点击“Retrieve/ID mapping”,跳转页面进入ID转换界面;3、上传ID列表,选择转换类型...

文章 合并同sample的vcf文件,通过bcftools

...下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解深入?图表看懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)...

问题 老师,我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行对,第一个我是用了你们给的TransDecoder下地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

上面是你们给的下地址运行出来的提示 这个是我自己数据运行的5.7版本提示

文章 R语言基础入门—判断语句

...ase 位置值,如果整数在位置的范围内则返回 NULL。如果匹配到多个值则返回第一个。expression如果是字符串,则对应的是 case 中的变量名对应的值,没有匹配则没有返回值。switch 没有默认参数可用。 以下实例返回第三个值: ...

问题 smart批量分析结构域 所有均为 no match

所有序列都没有匹配,好奇怪,知道哪里有问题?也试过将文件上传的方法都

文章 在线绘制circos的数据格式说明

在 教你在线绘制circos图-简单!介绍了circos图的在线绘制方法,这里再介绍一下输入文件的格式。 1.您上传的文件必须是纯文本数据。该文件可以是空格或制表符分隔的。行名可重复。列名亦是如此,行列名可相同。每一行...

问题 MEME分析中,motif的E-value值太高,意味着准确了。对吧。

... 所以我需要调整参数,将motif设置成5才对。是吧。 我在分析时可以说:根据预测结果,结合E值,我的基因家族中,有5个motif。 ****************************************** 我选择motif个数5重做了一次。结果基因家族中,有部分序列没有m...