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文章 年龄相关性黄斑变性AMD

...进一步研究AMD的分子发病机制,寻找AMD相关的生物标记物,更好地为AMD的诊断、治疗和预防提供科学依据,本实验研究基于生物信息学方法对AMD患者的转录组学数据进行分析,发掘出AMD发病过程中可能发挥重要作用的基因并进行验证,...

文章 2019基因编辑最新进展，CRISPR/Cas9还有优势吗？

...推向临床，这就需要越来越多的研究人员能够利用RESCUE来更好地了解致病突变，这中间可能还需要一段过程，也让我们拭目以待。 　　因此，我们可以发现，虽然有了新型的碱基编辑器，现在正火热的CRISPR/Cas9还是有目前不可...

文章 送你一个小巧好用的序列分析软件-APE-功能强大，操作简单！

...，引物前数字是引物起始位置： 3. 序列比对 打开两个序列文件，点击Tool中Align two sequence，可以对两个序列进行比对，其中不同序列部分会红色标注，序列差异一目了然。 4. 与NCBI序列比对 APE软件还可以将序列直接与NCBI数...

文章 多基因间共线性及局部基因水平的共线性

... 三基因组共线性分析 之前的文章讲的是葡萄与桃子两个基因组的共线性分析，除此之外，如果我还关注桃子与可可基因组之间的共线性，那么我们是否可以将三个基因组的分析结果放在一张图中呢？答案是肯定的，具体方法...

文章 16S多样性分析docker镜像发布及使用

...ime1并且也习惯使用qiime1的分析流程。因此我们提供这个ampliseq1镜像仍然安装qiime1，但也会安装：mothur ，usearch 软件方便大家分析数据，qiime2会安装在另一个单独的镜像中，后续发布； 镜像下载使用方法 1）首先系统中docker安装...

文章 性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

...拔区域高寒胁迫和强紫外线照射胁迫相关； Torsten Günther1,2, Christian Lampei1, Ivan Barilar1, and Karl J. Schmid1. Genomic and phenotypic differentiation of Arabidopsis thaliana along altitudinal gradients in the North Italian Alps.2016.Molecular Ecology.

文章 从罗永浩直播刷屏，来看如何做好项目管理

...PT”项目经理。 一时间仿佛只要一张能说会道的嘴，一个出人意料的观点，再加上一篇花里胡哨的PPT，就能让投资人心甘情愿撒币，让观众老爷们乖乖掏空钱包。 罗永浩正是看准了时机，联想到自己优异的口才和诸多的拥...

问题 老师，您好，找不到临床数据该如何解决？

&gt; # 读取输入的参数 &gt; expr_file <- "/Volumes/HUBGENE/TCGA/methylation/lab/GDC/TCGA_OV_methylation.txt" &gt; clin_file <- "/Volumes/HUBGENE/TCGA/methylation/lab/Clinical/GDC/TCGA_OV_clinical.txt" &gt; work_dir <- "/Volumes/HUBGENE/TCGA/methylation/lab" &gt; p_cutoff <- 0.0...

文章 CAR-NK疗法：优势详解与应用前景

...安全性高   CAR-NK细胞免疫疗法比CAR-T细胞免疫疗法具有更好的安全性。CAR-T细胞免疫治疗的主要副作用之一是由于CAR-T细胞的持续存在而产生的靶向效应。相反，由于CAR-NK细胞细胞寿命短，发挥作用后即消失，避免了活化细胞在...

文章 cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分

...lass.com/article/507 其中给大家介绍到了pheatmap返回结果是一个列表，其中包括行列聚类的返回结果，而这一结果又是基于hclust聚类返回的结果，这里刚好可以利用cutree函数对其聚类结果进行划分。 首先基于pheatmap参数cutree_row查看...

文章 本科生到底要不要进实验室？怎么进实验室？

刚好处于开学季，所以学霸姐姐想聊一聊这个话题， 之所以说这个话题的契机是—— 前几天，学霸姐姐看到了中科大的迎新报道，一位来自东北吉林的女生， 在被校园记者问到“大学最想做的事情是什么?”时， 斩钉截铁地...

文章 总结：生化检测实验样本值不准的原因分析

...目前临床上常用的抗凝剂有EDTA-2K、肝素、枸盐酸钠等，TBA和AFU不能用肝素抗凝剂，因为肝素会使TBA和AFU试剂发生混浊，导致吸光度假性偏高，从而使检测结果偏高。所以认真参阅试剂说明书，按照要求采集正确标本。 还有，标...

文章 R 包 osqp安装报错

 used as include directory in directory /tmp/RtmpcLds4H/R.INSTALL113b0185bd284/osqp/src/osqp_sources/lin_sys/direct/pardiso CMake Error in CMakeLists.txt:   Found relative path while evaluating include directories of "osqpstatic":     "R_INCLUDE_DIRS-NOTFOUND" CMake Error in lin_sy...

问题 老师，求助，转录组差异表达基因分析报错-只有pfd文件没有PNG文件，且PDF打不开

[root@9dfb61184b6e  08:23:54 /work/my_rnaseq/5.deg]# Rscript $scriptdir/heatmap.r -i $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -l S10_vs_J10.DEG.final.tsv -p S10_vs_J10.deg_gene_heatmap -o ./ --&gt; Q&amp;A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --&gt; R beginners...

文章 eggNOG批量注释基因组数据库

数据库下载：   http://eggnog5.embl.de/download/emapperdb-5.0.2/ http://eggnog5.embl.de/download/ $ md5sum eggnog.db eggnog_proteins.dmnd   #下载完成之后核对md5值065763df8f1593dc6d08c5ce06401fcf  eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd  eggnog_proteins.dmnd 利用docker...