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文章 学了很多项目管理工具和方法,为何还是难以成功?

83版《西游记》里有一个桥段： 金角大王拿着宝葫芦对孙悟空说：“我叫你名字，你敢答应吗？” 孙悟空不知情，回了句：”爷爷在此“。 然后就被吸到宝葫芦里去了，金角大王成功拿到一血。 这个桥段相信大家已经看过...

问题 如何合并两个单细胞测序中的两个子集？

...行了重聚类，resolution都是0.2，然后生成了CD8new.added.celltype.rds和NK.added.cellytype.rds两个文件，现在我要把这两个文件，但总是提示报错。 CD8new.added.celltype.rds的meta文件：CD8.added.celltype.metadata.tsv NK.added.cellytype.rds的meta文件：NK.added....

问题 tophat2建立索引报错：Error: gtf_to_fasta returned an error.

...候出现报错； "/share/work/biosoft/tophat/tophat-2.1.1/bin/tophat2" -G Sspon.v20180123.gtf --transcriptome-index=transcriptome_data/known Sspon.HiC_chr_asm [2019-04-28 05:49:42] Building transcriptome files with TopHat v2.1.1-----------------------------------------------[2019-04-28 05:49:42]...

问题 [main] unrecognized preset 'china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz'

我用命令过滤后vcftools --gzvcf china-wild-ibex-clean.vcf.gz --max-missing 1.0 --recode --stdout | gzip -c > china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz  在去建立索引tabix -p china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 这个文件出现下面的错误是怎么回事？

文章 qiime2 q2-picrust2 报错问题

Traceback (most recent call last):   File "/share/work/biosoft/python/Python3/bin/picrust2_pipeline.py", line 4, in <module&gt;     __import__('pkg_resources').run_script('PICRUSt2==2.5.2', 'picrust2_pipeline.py')   File "/share/work/biosoft/python/Python-v3.9.16/lib/python3.9/site-packa...

文章 序列比对Muscle和ClustalW的区别

...再次点击比对，检查是否大部分都对齐了。 参考回答https://www.jianshu.com/p/1112693391ca

文章 perl中判断数组中是否含有某个元素

grep 函数可以解决这个问题，下面介绍grep的用法： grep函数有两个参数。一个代码块和一个列表。 对于列表中的每个元素，它的值会被赋到$_（Perl的标量默认值）, 然后执行代码块。如果代码块的返回值是false，相应值被丢弃。...

问题 在virtualbox中导入虚拟电脑的bio-linux的ova失败~老师

报错信息： 导入虚拟电脑 E:\Bio-Linux-2018-8-23.ova失败. Could not create the imported medium 'F:\bio-linux\Bio-Linux-2018-8-23-disk001.vmdk'. VMDK: cannot write allocated data block in 'F:\bio-linux\Bio-Linux-2018-8-23-disk001.vmdk' (VERR_DISK_FULL). 返回 代码:VBOX_E_FILE_ERROR ...

文章 linux下安装java

... vim /etc/profile把下面填进去 #set java environmentJAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.151-1.b12.el6_9.x86_64JRE_HOME=$JAVA_HOME/jreCLASS_PATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar:$JRE_HOME/libPATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin:$JRE_HOME/binexport JAVA_HOME JRE_HOME CLASS_PATH ...

问题 mysql镜像启动问题

...sql cd mysql mkdir log data conf  #下载mysql 官方镜像  #docker pull mysql:5.7 #启动镜像 docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \ -v $PWD/log:/var/log/mysql \ -v $PWD/data:/var/lib/mysql \ -v $PWD/conf:/etc/mysql \ -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \ -d mysql:5.7 老师，我...

文章 DockerHub镜像无法下载的解决方案

...4年8月30测试可用。Docker镜像加速站设置（linux）sudo mkdir -p /etc/dockersudo tee /etc/docker/daemon.json <<EOF{    "registry-mirrors": [        "https://hub.uuuadc.top",        "https://docker.anyhub.us.kg",        "https://dockerhub.jobcher.com",        "http...

问题 我现在遇到的问题就是在基因家族中去除多余的转录本的时候提取不到对应的基因号

#geneIDmRNAID BGIOSGA001544-PABGIOSGA002576-PABGIOSGA002811-PABGIOSGA004679-PABGIOSGA005940-PABGIOSGA005943-PABGIOSGA006009-PABGIOSGA006978-PABGIOSGA007501-PABGIOSGA008831-PABGIOSGA009909-PABGIOSGA010345-PABGIOSGA012193-PABGIOSGA013468-PABGIOSGA013470-PABGIOSGA015005-PABGIOSGA015006-PABGIOSGA016495...

文章 bwa-mem2的用法

...本极大降低了内存和存储使用量（使用了FM-index，和 8x compression） 最初的bwa是由李恒开发的. bwa-mem2的性能增强主要由英特尔并行计算实验室的Vasimuddin Md（@yuk12）和Sanchit Misra（@sanchit-misra）完成。Bwa-mem2在麻省理工学院许可证下...

文章 怎么做一张好看的分类学树状图

...分类学组成信息可视化软件——GraPhlAn，用它生成的图会更好看哦！ GraPhlAn 安装 首先，是GraPhlAn 的下载安装。 在linux环境下使用如下命令进行下载： hg clone https://hg@bitbucket.org/nsegata/graphlan 然后将路径添加到bash配置文件中，...

问题 Error in UseMethod("groupOTU") : no applicable method for 'groupOTU' applied to an object of class "NULL" Calls: groupOTU Execution halted

各位老师，我在绘制进化树的过程中，使用命令ggtree.r -t fasttree.nwk -f $GROUP -g Group -n fasttree，运行后报错，出现下图报错，请问老师，我应该怎么处理呢？