找到约 15 条结果

文章 论文作者署名:导师和学生之间的一场大战

...? 一般来说,文章的主要撰写人应该是学生, 所以目前比较常见的是,最终学生会是第一作者,老师为通讯作者, 这应该是惯例,但是也不排除像第一个新闻里的那样,导师非要署名第一作者。。。 因为学生做老师的课题...

问题 SNP获取

...at clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l查看不同样品共获得多少SNP,那如何查看每个样品各自拥有多少SNP呢?在该文件SNP_gene_ann.stat中可以查到每个样品的SNP,但是总数和使用指令zcat clean.vcf.gz|grep -v "#"|wc -l获得SNP总数不一致,那SNP总数应该...

文章 使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

compare_means()函数用于比较两个或多个独立样本之间的均值。 compare_means( f, data = mydata, paired =FALSE, method = "t.test") #函数的普遍用法 f : formula,x ~ group形式的公式,其中x是表示数据值的数值变量,group是表示相应组的具有一个或...

文章 单细胞RNA速率(RNA velocity)分析结果解读

...偏差。稳态下的 mRNA 水平近似于: 在假定稳态状态下线性回归模型的上下分位数。这种简化方式主要基于两个基本假设: 跨基因的共同剪接率和数据中待反映稳态 mRNA 水平。当细胞转录不符合上述假设时,就可能导致速度估计和...

文章 UALCAN--TCGA数据挖掘网站

...达和下调表达的将分开显示,其中第一页一般显示Top25,调整页面数,可以显示其他结果,同时使用者可以选择不同的图片保存格式(见下图)。 目标基因深度挖掘 在经过数据的初步分析和相关筛选之后,针对筛选出的目标...

问题 qiime2调用dada2报错

在mac上用qiime2调用dada2报错 在mac上使用qiime2调用dada2报错,请问老师如何解决?

文章 tar 多线程加速打包速度

...6 S 84.3 0.0 3:34.92 pigz 遇到单个大文件的时候,CPU使用率会比较高一点 PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND 18241 root 20 0 38676 724 576 R 126.2 0.0 6:47.93 pigz 最后发现只用了40分钟就解压完,之前用了超过2个半

文章 awk正则表达式使用外部变量

...产生的中间变量,还需要在shell中继续处理。 一、那如何在awk中使用在shell中定义的变量呢? 方法一:使用"'把shell变量包起来,即"'$var'";注意是“双引号+单引号+shell变量+单引号+双引号”的格式。 这种写法大家无需改...

问题 高通量下载数据格式

...下,直接按照runinfo 信息下载的数据的格式是什么格式?如何转化为fastq格式? 如下面的下载地址:https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos2/sra-pub-run-11/SRR1218151/SRR1218151.1

问题 McscanX找组内复制基因,组间复制基因

某个物种用mcscanX组内找到的物种复制基因对与组间找到的物种复制基因数量不等是什么原因?如何取舍?

文章 流式细胞术一定要设置对照组吗?对照原则了解下

...结合而产生的背景染色。 图:空白对照和同型对照的比较 如何选择同型对照? 一般选择相同种属来源、相同亚型和亚链、相同荧光标记但由未免疫动物血清纯化而来的抗体,比如抗鼠的CD11b BV711标记的抗体,成份是Rat IgG2b, κ...

问题 替换蛋白编号信息的问题

我按照老师的方法pel get_fa_by_id.pl  at.gff arabiopsis_thaliana.tair10.pep.all.fa pep.fa 替换蛋白编号信息(删除其他转录本的数据),代码执行通过没有报错,但pep.fa替换后的文件为空,请问如何解决?代码是老师上课中用的代码

文章 TCGA-ceRNA网络构建

...,所以他们之间存在一定的相互作用。 目前在TCGA中研究比较多的是lncRNA, 编码蛋白的基因以及miRNA 三者之间的ceRNA调控网络。 构建ceRNA 网络,需要进行两类分析: 1. 差异表达分析: 分别对lncRNA, 编码蛋白的基因,miRNA 进行差...

文章 GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

...E149614 count表格输入):https://www.omicsclass.com/article/2513 非細胞肺癌(NSCLC)(GSE127465 indrop数据) : https://www.omicsclass.com/article/2515 非细胞肺癌 (GSE139555 10X 多样本批量):https://www.omicsclass.com/article/2532 结直肠癌 CRC(GSE146771 s...

文章 组学大讲堂周年庆特大优惠---VIP最高返礼6800元!!

...情页:VIP详情页 点此处联系客服了解详情:客服 省钱能手,性价比爆棚原价21980元的超级VIP限时限量6.9折优惠(券后15166元,限量10个名额),还送独享服务器 7.8 折券,租服务器都能省钱。 注:亦可选择原价购买享优惠...