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问题 docker GetOrganelle的批量组装

如何修改课程中使用的docker代码,以实现GetOrganelle的批量组装

文章 IF=8.5|一千多个酵母基因组分析揭示基因家族进化的独特轨迹

...54个酿酒酵母(Saccharomycotina)基因组中基因家族的大规模比较表明,基因的获得和丢失驱动着酵母的进化。进化速度越快的谱系丢失的基因越多,物种形成的速度也越快,这凸显了基因家族收缩的作用。 01 — 文章内容 1. 基...

文章 biom格式的文件如何转化

biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys less feature_table_tax.tsv # Constructed from biom file #OTU ID FT-1 CKR-4 CK0-1 ...

文章 grep --color=auto使用用法介绍

...名。 grep --color=auto默认的颜色为红色,在黑色的背景上比较显眼。但是在其他背景颜色下,可能不太好看。这时就需要设置背景颜色。 使用grep --color=auto可以支持以下几种背景颜色: black,red,green,yellow,blue,magenta,cyan,white 设置...

文章 以OKR驱动企业项目化管理变革

...”的问题,是定性的; 关键结果(KR)回答的是“我们如何知道自己是否达成了目标要求”,是定量的; 企业可参考长远目标,将整体经营过程,按照工作性质的不同、时间安排的先后次序,分解成若干相互关联的阶段,分阶...

问题 基因家族分析 基因家族基因在不同物种之间的进化同源关系

...一步最后画图时,现如下问题: 我一共做了5个物种的比较,以下是我的文件内容截图: 我看主要是TAO和FN的基因在bed文件里找不到,,但是我在bed文件手动搜索报错的第一对:evm.model.chr0.498 evm.model.chr0.533 ONI03914 ONI03980是...

问题 annovar报错问题

您好,请问您annovar的报错问题: Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677 如何解决的呢?

问题 annovar报错问题

您好,请问您annovar的报错问题: Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677如何解决的呢?

问题 circos图的名字显示问题

如何书写配置文件让基因名字显示在一起且不重叠呀,改成这个样子的呢

文章 农艺性状表型数据与环境关联互作分析R代码

...on", MARGIN = 2),2)trait.mean=cbind(`平均值`=MEAN,`标准差`=SD,`变异系数(%)`=CV,`变幅`=paste(range.min=RANGE[1,],range.max=RANGE[2,],sep="-"),`多样性指数 H’`=H)write.csv(trait.mean,file="01.马铃薯表型性状统计.csv")#################################相关性分析occor =...

文章 好实验从一个好的样本命名开始!

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

问题 重测序mapping rates

mapping rates 有的样品值在60左右,请问老师如何把没有比对的reads进行blast?来判断没有比对上的reads是什么?

文章 BSA分析中QTL-seq 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的

这里R语言源代码,有兴趣的可以研究看看 ####################################Arg<-commandArgs(TRUE)###########input###############################################individual_analysis<- c(Arg[1])reprication<-c(Arg[2])filter_value<-c(Arg[3])population_structure<-c(Arg[4])...

问题 有参转录组

...红色部分的原因因为只有一个样品。如果是一个样品又该如何修改脚本内容。难道是下面一个参数?,但是修改了结果一样

文章 Cytoscape如何基于点的属性快速对点和相连的线进行颜色分类

在利用Cytoscape绘图的过程中如何对具有不同属性(分类)的点(以及与该点相连的线)进行颜色着色呢? 譬如下图 显示了miRNA 和靶基因的相互作用,并基于靶基因的类型对网网络图进行了颜色处理,方便显示各个分类: 绘...