这个是NCBI中转录组数据中的ID 这个是我的基因ID
用的是泛基因组分析2.0，泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下 前面的建立批量链接也没有报错 影响到后面的命令都是报错找不到fa.gz或者gff3.gz
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...码子前1500bp），顺式作用元件种类及分布情况，具体某个数据时可以选择自己感兴趣的基因、顺式作用元件进行展示。 今天给大家介绍一款非常简单实用的在线软件GSDS：访问地址：http://gsds.cbi.pku.edu.cn；GSDS全拼是：Gene Structure ...
Rscript ../tcga_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r -g GSE12417 -o GSE12417-array --skip 27直接下载会报错，这里手动下载：#手动下载 matrixwget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE12nnn/GSE12417/matrix/GSE12417-GPL570_series_matrix.txt.gz -O GSE12417-array/GSE12417-GPL5...
...genome.pep.fa #蛋白质序列 说明： -in：建库序列 -dbtype：数据库类型 以蛋白质序列为例，运行结果： 2 . 比对 blastall -i Aphidoidea.fa -d genome.cds.fa -p blastn -e 1e-10 -b 5 -v 5 -m 8 -o yachong.blast 说明： -i：需要比对的文...
...indows下就能操作的，十分便捷的venn绘制方法： 一、输入数据准备： 首先要准备的是各比较组（比如CK1比上Treat1）的差异基因列表，一般公司做完的标准分析结果里已经包含这部分内容了，通常在“DEG_Analysis”文件夹里，我们...
请问https://www.omicsclass.com/article/872帖子里说的分离NR/NT数据库的脚本和所需文件，gi_taxid_nucl.dmp.gz和gi_taxid_prot.dmp.gz文件无法下载，提示没有这个文件，请问这两个文件现在变成什么了？现在数据库都更新了，请问还能用这个方法...
#! /usr/bin/python # -*- coding: utf-8 -*- import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np # Fixing random state for reproducibility np.random.seed(19680801) plt.subplot(211) #绘制一个两行一列的图，并对第一个图进行绘制 # 参考链接https://www.jianshu.com/p/de223a7921...
需要token 使用说明：https://docs.gdc.cancer.gov/Data_Transfer_Tool/PDF/Data_Transfer_Tool_UG.pdf
...有1000多样本，用课程里循环的方式太麻烦了，而且我的数据都不在一个文件夹，数据的命名规则也不一致，目前已经将样品名，双端数据都整理在一个list里了，有没有相关脚本来替换课程的循环脚本？ 课程里给的脚本里好多...
...叶变换（FFT）来提高比对的速度和准确性，适用于大规模数据集的处理。MAFFT提供了多种比对策略，包括自动选择最适策略的选项，使其能够灵活应对不同的比对需求。 使用条件 MAFFT可以在Linux、MacOS和Windows操作系统上运行。...
...不是这样。 本文将介绍笔记本中的哪些部件会影响生物数据的处理速度，选购笔记本时应当注意的问题，有需要的同学赶紧收藏本文吧！ 两点说明： 1. 本文仅适用想买自用笔记本顺便兼顾下生信分析的同学，如有海量数据...