问题 在共线性分析中发现结果太少

在共线性分析中发现结果太少，将minspan=30改为=0后结果仍然很少，能不能调整cscore的值呢，这个值指向的是哪个参数啊，是类似于E值的存在吗，怎么调整比较好呢

文章 seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选

seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除

文章 perl中判断数组中是否含有某个元素

...grep函数有两个参数。一个代码块和一个列表。 对于列表中的每个元素，它的值会被赋到$_（Perl的标量默认值）, 然后执行代码块。如果代码块的返回值是false，相应值被丢弃。如果代码块返回值是true, 相应值会作为返回值之一...

问题 #提取cds 用基因的id，作为序列的id；；1.这条指令如何修改，我想保留第一个pbr013511.1，这条指令只能保留中间部分 2.提取完cds和pep后，>DAnjou后面的内容，没有基因ID，ANQ为他的gff3文件 3.同样也是提取完cds和pep之后，>后面内容无基因id；DL为gff文件

问题 MEME motif 统计每条序列中motif的种类

...图片形式直观展示motif分布以外，还想统计一下每条序列中motif的分布情况。请问该如何批量操作？ 在得到的结果文件中，有看到下图所示的motif信息。[ ]之间的括号以外的数字表示motif编号，但是不知道该如何批量提取。 非常...

问题 关于小麦基因家族中的同源性问题

你好，我想问一下，对于小麦的基因家族来说，如何判断基因在小麦ABD三个家族中的同源性呢 能跟我讲一下具体的操作方法和流程吗，谢谢，感激不尽

问题 我想问一下，什么叫做新的基因，比如说我做的无参转录组，找到的差异基因能在NR数据库中注释到别的物种中，这个算是新的基因吗？

问题 在鉴定长链非编码RNA分析中，合并转录本之后，如何批量从gffcmp.combine.gtf文件中提取class_code为i, u,和x的转录本?谢谢

用户 生长中的乙弘菌( 'ч' )

文章 MNP标记设计中DP的计算方法

MNP标记设计中多态性窗口的筛选标准为DP指标： DP= t / c ( N ,2)，其中c ( N ,2) 是N 个品种中任意两种的品种组合对数， t是每对品种在窗口内至少有两个分散的 SNP 的数量。 如下所示： 假如有3个品种，1个窗口内有3个SNP。其中品...

问题 找不到课程中需要的镜像

文章 GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入： IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践：https://www.omicsclass.com/article/1673 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践： https://www.omicsclass.com/article/1677  BCC 基底细胞癌（GSE123813 count表...

文章 遗传家系图代表意思以及绘制技巧

一、家系图详细讲解 通过对家庭成员中某种疾病的发病情况进行调查分析可以判断该病是否为遗传病。通过家系调查可以绘出家系图（或称系谱）来显示某种疾病在家族中的传递特点，借此判断该病是否为遗传性疾病及其遗...

问题 怎么在word中打出表示注册商标的r

论文写作时方法部分会有仪器商标R，在word中如何插入：

问题 一个基因家族中的每个基因有多个转录本，如何取舍？

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