16S多样性分析docker镜像发布及使用中,合并fasta文件,并加序列号部分的命令中,rename_fa_id.pl显示没有此命令,请问老师是怎么回事?

qiime1分析pick otu 聚类,16S多样性分析docker镜像发布及使用中,合并fasta文件,并加序列号部分的命令中,rename_fa_id.pl显示没有此命令,请问老师是怎么回事?
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2 个回答

肥尔普嵩


#合并fasta文件,并加序列号
for i in `cat $fastmap |grep -v '#'|cut -f 1`do 
    rename_fa_id.pl  -f $workdir/4.remove_chimeras/$i.ref.nonchimeras.fa \
        -n $i -out $i.fa
done
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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

镜像使用方法及代码:https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

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