...去挺顺利的，但实际到了验收阶段，就频繁出问题，不是功能的缺失，就是进度的delay，甚至于需求开发完之后，和当初的预期差别很大。 如此种种，可将其归结为是在项目执行/监控过程中验收的问题，没有做好验收的准备...
我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具，而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计，比较耗费时间，最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做，只要阐述清楚自己的需求，AI就是很好的...
...上。 现有用于免疫浸润评估的算法可分为两大类：基于标记基因的肿瘤浸润免疫细胞量化方法和基于表达特征对细胞混合物进行反褶积的肿瘤浸润免疫细胞量化方法。基于特征基因集的方法是通过使用组织样本中这些特征...
...比对预设参数 # -t 24：使用8线程 # -c：输出CIGAR字符串# 基于ragtag进行格式转换ragtag_paf2delta.py -r ref.fa -q genome1_standard.fa 前缀.paf > 前缀.delta 2. 过滤比对结果 delta-filter -r -q -i 90 -l 100 前缀.delta > 前缀.1delta#-q：查询序列锚定...
...。 1.选择工具 选择Java打开软件TBtools，这个软件有很多功能，此次的目的是将xml文件储存的motif locations信息转化为图片。工具选择如下图所示： 2.输入文件 如下图所示点击右侧红色方框中的按钮选择输入文件也就是MEME结果中...
...步处理 SAM 文件，例如转换为 BAM 文件、排序或进行其他分析。
我运行下面的你们给的代码 RepeatMasker -e rmblast -gff -xsmall -html -norna -source -no_is -pa ${threads} -s -lib allRepeats.final.lib contig.fa# -e rmblast 指定搜索引擎为rmblast，还可以选择crossmatch、abblast或者hmmer# -species "Danio rerio" 指定物种为斑马鱼...
...学意义。 2、PICRUSt的特点 PICRUSt算法的一大特点，就是基于Greengenes的16S rRNA基因全长序列数据库，对菌群测序结果进行“封闭式”参考OTU划分。PICRUSt开发者对古菌和细菌域的大多数模式微生物的功能进行预测，让人欣喜的是...
...cob-cbi-hem的发生和多样性，并进行了体外发酵试验以测试基于性状的活性。 01 — 实验设计和结果 为了调查携带pdu的微生物的出现和多样性，作者采用了一种非靶向方法，对代表不同饮食类型的25个粪便样本（17个食草动物，...
细胞的基因表达谱决定了细胞的功能和细胞的状态，在单细胞研究中，我们一般通过做差异基因分析来寻找我们感兴趣的疾病特异性表达的基因，从而研究疾病的发生发展。但差异基因分析存在统计假设检验的大前提，所以可能...
...序的物种进行比较基因组学的分析，分析某一家族的基因功能，并且可能通过延伸实验的方式在物种"A"中加以验证，请问以上想法靠谱吗？ 注：问题的关键在于从分类学层面来说，同一“目”下的物种基因组差异性大不大；比...
...mData\anaconda3\Library\bin Jupyter打开使用 Jupyter Notebook是基于网页的用于交互计算的应用程序。其可被应用于全过程计算：开发、文档编写、运行代码和展示结果。简而言之，Jupyter Notebook是以网页的形式打开，可以在网页页面...
...是项目开发中的统一整体。因此，我们将其与技术经理的功能进行比较。当一家公司有大量项目进行时，其中一些项目应该属于同一类型，这时是让项目经理发挥作用的时刻，项目经理协调一组项目的工作，并与管理每个特定项...
...要仔细思考，例如更换距离矩阵再行尝试。 或者，不再基于样方得分，而是尝试使用物种得分与环境变量进行多元回归拟合（参数display = 'lc'）。尽管物种信息在相异矩阵的计算过程中丢失，但是物种得分仍然可以通过物种变...
...ted / 384 down-reguated）。GSE15641数据利用GEO2R进行差异分析，基于P.value<0.05 & |log2FC|>1 筛选到1794 个差异基因（884 up-regulated / 910 down-reguated），该部分筛选结果用于biomarker的相关验证。 2.加权基因共表达网络分析 TCGA数据筛...