泛基因家族分析结构变异与基因表达分析

老师,我在做泛基因家族分析中,结构变异与基因表达分析,#删除一些不需要的基因的表达量(B73的一些基因在其他物种中不存在同源基因)

perl $scriptsdir/grep_famgene_fpkm.pl WRKY_gene_fpkm.xls ../03.PAV/PAV_gene.list WRKY_gene_fpkm.filter.xls ${ref}这一步,使用指令perl /work/scripts/grep_famgene_fpkm.pl GRAS_gene_fpkm.xls  /work/03.PAV/PAV_gene.list GRAS_gene_fpkm.filter.xls ${ref}   但得到的结果没有基因组名称列,请帮忙看看是什么原因?

以下是我的文件

attachments-2025-07-YyR9seYj686e32c907c43.jpgattachments-2025-07-piujMSB2686e32d4763f2.png

这是使用的老师的脚本attachments-2025-07-jqwiprk8686e32f06b440.png下面是得到的结果

attachments-2025-07-J6UrlqW5686e330a2634a.png

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1 个回答

rzx

GRAS_gene_fpkm.xls  输入文件有问题。将首行首列“gene_id”改为“ID”。跟示例文件列名保持一致

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