对的就是蛋白id跟我注释文件中的mRNA不对应,然后我利用脚本提取CDS也提取不到。我下载的是Oryza_indica.ASM465v1.53这个基因注释文件。
然后我反复比对,我只能猜测是那个脚本提取的基因号是不是不对应啊。
然后我想做的是目的基因家族在水稻里面的鉴定,不知道我下载的水稻基因库是不是正确的,
多谢老师!!!
#geneIDmRNAID
BGIOSGA001544-PABGIOSGA002576-PABGIOSGA002811-PABGIOSGA004679-PABGIOSGA005940-PABGIOSGA005943-PABGIOSGA006009-PABGIOSGA006978-PABGIOSGA007501-PABGIOSGA008831-PABGIOSGA009909-PABGIOSGA010345-PABGIOSGA012193-PABGIOSGA013468-PABGIOSGA013470-PABGIOSGA015005-PABGIOSGA015006-PABGIOSGA016495-PABGIOSGA025712-PABGIOSGA026849-PABGIOSGA037938-PABGIOSGA038642-PABGIOSGA039232-PABGIOSGA039662-PABGIOSGA040099-PA