在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面，而子代双池在前面，这种怎么把顺序调整过来？有没有影响

老师在课程中使用的示例文件中vcf文件中四个样本的顺序是双亲，然后子代。但是我发现我的vcf文件的顺序是双亲在后面，两个子代池在前面，这种怎么调整顺序呢，或者会不会影响qtlseq的运行

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2021-02-22 10:40

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果用的是组学大讲堂提供的docker镜像就不需要更改，只是命令行参数样本名字写对就可以，因为我们对qtlseq这个python脚本做过修改；

但是，你自己安装的软件就按照软件说明使用。