如何从TCGA下载长链非编码RNA的数据?

一些文章中说长链非编码RNA的表达数据是从TCGA数据库中下载的,请问如何下载lncRNA的数据?

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1 个回答

microRNA

GDC上有TCGA的公开的转录组数据可以下载,

但是转录组数据中其实包括了编码蛋白的基因,lncRNA, 假基因等不同的基因的表达量,可以基于lncRNA对应的基因ID,从中抽提表达量。

可以参考我的文章《从GTF中提取lncRNA的编号和名称

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