如何将TCGA中下载的CNV数据：GDC_Aliquot转为Hugo_Symbol, Segment_Mean转变为拷贝数变异的5个离散值（0：无变化 1：拷贝数增加 2：高水平扩增 -2：纯合性缺失 -1：半合子缺失）。如下图所示

attachments-2020-05-chjTt7f45eba5f7552a32.png

将上图转变为

attachments-2020-05-T32o2cNS5eba607177d44.png


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

用python 或者perl写个脚本转换以下就好了；

perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精通

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  • momo 提出于 2020-05-12 16:39

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