生信老顽童
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221 个回答

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《微生物多样性数据分析实操》课程资料的下载

课程里有下载地址的。

回答于 2020-10-09 08:54

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按照课程筛选串联重复基因,找到了6对,然后绘制了circos图如下...

小兰老师的课程早就都更新了,你可以在网易云课堂上看看最新版的。 https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-09-27 09:57

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差异基因用p-vaule筛选可以吗?

当差异基因很少的情况下,如果调整FDR和差异倍数都无法增加差异数量的话。退而求其次的方法就是直接使用pvalue值来筛选差异。这样差异的数量可能会多一些。不过相应的假阳性也会高一点。 不过有些样品,比如细胞样品,由于背景相似度非常高,很有可能出现差异很少的情况。这时候就可以酌情考虑直接使用pvalue值。通过pvalu...

回答于 2020-09-19 15:58

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研究非编码RNA功能的方法有哪些?该如何选择?

非编码RNA是没有功能的,比如lncRNA、microRNA、circRNA等,如果要研究功能,需要研究这些RNA的靶基因或者来源基因的功能。

回答于 2020-09-08 08:59

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如何获取苹果所有蛋白在kegg中的大K号?

那你需要进行kegg注释之后才知道。

回答于 2020-09-05 09:55

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Omicsclass的网站源文件在哪里下载呢

你直接在docker下下载相应的镜像即可。

回答于 2020-08-26 09:06

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老师,mega构建好的进化树,怎么导不出来,按照步骤来的,点导出...

你得看看你导出的什么格式的,没有导出来应该是你某个步骤出错了。你再操作一下吧

回答于 2020-08-23 15:51

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老师,您好,请问一下利用基因在不同组织的FPKM值做热图,怎样计...

你想计算FPKM的话,你得有测序的原始数据,然后使用原始数据从头分析,然后计算FPKM值。 如果你研究的物种有参考基因组的话,可以学习我们的 RNAseq有参转录组数据自主分析 https://study.163.com/course/introduction/1005267042.htm?share=1&shareId=1031484705

回答于 2020-08-18 08:38

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docker 运行meme motif analysis 时显示无meme这个文件

你的命令路径有问题,你检查一下。另外我看你没有按照视频的目录结构进行操作,你再看看视频,在没有完全理解学会的情况下,建议严格按照视频的目录路径进行分析。

回答于 2020-08-18 08:36

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老师,在ensemble下载斑马鱼和大黄鱼的时候,gff3文件和pep等的I...

你最好贴一下你的gff文件,我们才能给你提出修改建议。

回答于 2020-08-15 12:36