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生信老顽童

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235 个回答

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第一次hmm搜索时可以搜索出序列，但是接下来一步提取结构域序列...

输入文件，输出文件，命令的截图。没有这些，无法推断的。

回答于 2020-07-12 11:36

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做完蛋白组后，验证如何做呢？

可以根据你的研究目的进行挑选相关的差异蛋白进行验证。

回答于 2020-07-12 11:35

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使用基因家族特异的隐马尔科夫模型筛选过蛋白质组库以后，发现含... 已采纳

提高阈值。数据库确认，然后二次搜索，再次确认。

回答于 2020-07-12 11:34

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在win7系统的文本里用快捷键ctrl+c复制了命令，但在bio-linux里...

在如下位置设置一下

回答于 2020-07-05 16:04

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请问老师转录组测序结果中的log2（fold change）值具体计算步骤...

有重复的使用的是deseq，没有重复的是ebseq

回答于 2020-07-05 16:03

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请问老师MYB基因分1R，2R和3R怎么分的？

这个你得具体查查相关文献了，或者可以看看pfam数据库里有相关说明没有。

回答于 2020-07-03 08:24

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基因序列获取老师，你好！在查找文献时，查到了想要的拟南芥基...

下载相应的基因组文件，里面有蛋白序列。如下图所示，ensemble上的拟南芥基因组上有相应的蛋白序列。

回答于 2020-07-01 17:44

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kegg注释问题

没有专门针对某个物种的kegg数据库。都是kegg数据库直接进行比对注释的。

回答于 2020-06-28 16:50

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基因组

这个你得自己查一下基因组发表的文章。

回答于 2020-06-10 08:46

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基因家族候选基因结构域鉴定老师你好！做bhlh基因家族分析，对...

我不知道你的鉴定思路和方法是什么，如果学我们的课程，一般是先搜索pfam结构域，找到之后，使用结构域进行hmmer搜索，然后对搜索到的结果进行数据库确认，剔除那些没有结构域的基因，同时，每个基因保留一个转录本ID。具体的可以学习我们的基因家族分析课程：https://study.163.com/course/introduction/1209048893.htm?...

回答于 2020-06-10 08:42