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基因家族分析--结构域在线数据库中确认

可以去并集,只要有一个数据库有就认为这个基因含有这个结构域;

回答于 2024-05-23 16:36

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在进行物种累积丰度曲线时提醒没有该命令

sh脚本前面有个export开头的命令需要运行一下,添加环境变量,shell才能找到这个脚本;

回答于 2024-05-23 09:13

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做基因家族共线性分析时,collinearity文件是空的,可能是什么问...

有些物种是没有的,有可能的; 一般动物里面会少或者没有; 你再检查检查你的输入文件是否正确吧

回答于 2024-05-22 10:52

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如何计算LD衰减到一半时的衰减距离?

对的,这两个文件里面都可以自己筛选一下的,r2值最大值与最小值的一半出对应的距离就是衰减距离;

回答于 2024-05-22 10:42

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对多个g.vcf.gz文件合并,遇到的问题?

超过500M的染色体,GATK 索引不支持; 1.解压g.vcf.gz  2. 解压后的vcf文件建立索引: gatk --java-options "-Xmx50g"  IndexFeatureFile -I  demo.g.vcf3.用解压后的g.vcf导入数据库 参考这里:https://www.omicsclass.com/question/7288

回答于 2024-05-22 10:39

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Docker 打开显示这个,但是我的wsl是新下的应该是最新的

按照报错信息更新 wsl,或者百度一下,或者购买我们的云服务器:https://study.omicsclass.com/index 省去安装的麻烦;

回答于 2024-05-21 17:38

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按要求下载完dockerwin11版后不运行怎么回事

有没有报错信息,没有的话重启试试的;

回答于 2024-05-21 15:45

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gwas

课程里面有的可以的,有的软件有PVE有的需要计算一下:https://www.omicsclass.com/article/2406

回答于 2024-05-21 15:43

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docker镜像更改

看看这个:https://www.omicsclass.com/article/1183

回答于 2024-05-21 15:42

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rnaseq分析中片段inner size出现问题

没有找到成对read的比对,你这个转录组是不是单端测序,单端测序没法评估这个; 或者你hisat比对的时候,输入read1文件和read2 文件,错误的都是输入read1 文件或者都是输入的read2 文件,检查命令行是否错误;

回答于 2024-05-21 09:52