omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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老师，我在用MCscan java family_circle_plotter时，出来的圈图...

gene_family,txt 这个文件和示例文件对比一下，我记得最开始有个名字；如果都检查没有问题的话，可能你的基因家族成员里面就没有大片段复制基因；运行这个脚本：detect_collinearity_within_gene_families.pl 检查一下有没有结果；

回答于 2020-04-03 12:09

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这个课程里面有详细讲解:基因家族分析实操课程、

回答于 2020-04-02 13:32

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输入文件都检查一遍，和示例文件对比看看哪里是不是出错；

回答于 2020-04-02 13:31

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有的，可以看看这个课程：https://www.omicsclass.com/article/275

回答于 2020-04-02 11:19

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vbox更新了，所以可能报错：https://www.omicsclass.com/question/2201/answer/2423

回答于 2020-04-02 09:33

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基因组上的基因包含内含子，我们的测序转录组数据是MRNA不包含内含子，所以比对的时候索引有外显子信息，更易于比对； http://daehwankimlab.github.io/hisat2/manual/

回答于 2020-04-01 11:59

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提交到三大数据库，做后续结构域搜索

回答于 2020-04-01 11:53

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这些不是乱码，是软件运行过程中的一些log信息，你可以看看看的，乱码是你看不懂的；

回答于 2020-04-01 11:52

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恩，保留一个作为代表就可以

回答于 2020-04-01 11:51

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这个自己查找文献吧，老师没做过这方面的

回答于 2020-04-01 11:50