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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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MISA

SSR引物批量设计可以看这个课程:https://bdtcd.xetslk.com/s/JKkbr

回答于 2021-03-20 11:39

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你好,我是初次接触网络分析绘图,在R中运行以下代码总是报错

可以学习我们的课程,高级分析内容里面有详细微生物共存网络分析代码讲解和示例数据;https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-03-20 11:38

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老师您好,我是刚接触生物网络分析的小白,在我做otu table 共存...

可以学习我们的课程,高级分析内容里面有详细微生物共存网络分析代码讲解和示例数据;https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

回答于 2021-03-20 11:35

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老师您好,我在下载GSE119767数据的时候,打开GPL,里面没有注释...

应该有的吧: 如果没有的话,你找作者要,不然换个数据分析吧;

回答于 2021-03-19 15:55

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老师您好,请问使用Docker时需要把测定数据定位到基因组上吗?

不明白你的意思, 测序数据比对到基因组上,可以用bwa 等软件,这些软件可以用docker 完成;具体可以学习docker课程: https://bdtcd.xetslk.com/s/3Rcvt0

回答于 2021-03-19 09:47

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如果提取基因一条代表CDS序列不成功,mRNA与CDS,GENE的ID都不一...

看课程这一节解决办法:

回答于 2021-03-19 09:44

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qiime2进行物种注释出错

运行的哪一条命令报的错误? 我猜是你的注释数据库没有做好吧;

回答于 2021-03-19 09:40

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老师您好!lumi包读取文件出错。Error in gregexpr("\t", dataLi...

你的数据格式和例子的数据格式不一致,每个样本少了几列数据:表头应该具有这样的数据:columnNameGrepPattern = list(exprs='AVG_SIGNAL', se.exprs='BEAD_STD', detection='DETECTION', beadNum='Avg_NBEADS'),例如: 如果没有的话,这个数据用不了; 我看了你这个数据,可以直接用里面的这列数据作为表达量 分析试...

回答于 2021-03-18 17:38

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多组GEO数据集合并

可以合并的的,合并之后可以做一下去除批次效应;https://www.omicsclass.com/article/1113

回答于 2021-03-17 11:43

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想问问老师和大家,blast搜索鉴定之后如何提取对应的domain呢

可以利用 NCBI的 CDD 工具再次确定结构域,知道结构域位置就可以提取相应的序列了;https://www.omicsclass.com/article/310

回答于 2021-03-16 15:49