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老师，我在做泛基因家族成员存在缺失分析时，做统计各个样本家族...
同学，其实前面已经给你说过解决办法了，最好的办法就是你重新跑流程，不要乱改你的基因id，你改了之后我们也很难改流程去对你的数据进行调试，你可以把构建泛基因列表的代码这里改一下，然后回到你修改id之前重新跑一下，总之不要改动你原始的基因id，不然后面对应起来就是很麻烦，你按照流程跑： # 把第二列的前缀去掉 a...
回答于 2025-04-07 13:33
老师您好，我在做泛基因家族分析中存在缺失分析得到的基因家族泛...
所以你在未做任何处理之前，你的gff文件里面基因ID的格式就是基因组名+基因id这样的是吗，我举个例子，比如说你的原始gff文件里面，你的基因编号就是C01_00G00000006对吗，要是你描述的这种情况，你需要把这条指令改成这样：awk 'FNR>1{print $1"\t"$3"_"$2"_"$3}' final.last.gene.pair.txt > yourfile.pan-genes.li...
回答于 2025-04-03 09:44
老师您好，我正在做泛基因家族分析中，家族成员存在缺失分析，需...
awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' 26Pan-genes.list > 26mazi.pan-genes.list
回答于 2025-04-01 16:01
泛基因集构建中JCVI做共线性分析构建完一半数据报错
last报错应该是因为内存不足：https://www.omicsclass.com/article/1413
回答于 2025-03-31 14:10
正在运行命令的docker因为断网后重启还可以继续运行上次的代码吗...
你这应该是没有跑完，你看下结果有没有正常生成，建议你重新执行一下计算kaks的指令，另外你不用把之前的容器删除掉，你这个容器还是up的状态，直接attach重连就行： docker attach 你的容器id
回答于 2025-03-31 10:07
kaks分析时候基因的txt文件中基因的出现乱序如何使用代码进行统...
我们的代码里面有对文件进行正确拆分的部分： 你是从上一步完整的跑下来的吗，如果你的PAVlist和示例数据格式一样的话不应该会出现这样的问题
回答于 2025-03-27 15:47
从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻...
你需要给我们提供一下明确的报错信息截图，你可以看一下发表问题的规范：https://www.omicsclass.com/article/82 因为软件报错的原因有很多种，需要有针对性解决
回答于 2025-03-27 09:21
老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文...
如果你的vcf文件格式规范的话，你可以试一下vcftools：https://www.omicsclass.com/article/647
回答于 2025-03-27 09:19