WGCNA分析,计算了软阈值,为什么powerEstimate没有提供估计值?

attachments-2018-09-frkL8yhb5b98d3949c8c3.jpg如上图所示,当软阈值等于32时,R2等于0.8,但是对应斜率在-1.34,这样的取值合理么?我知道最佳的阈值的选择要求R平方在0.8以上,斜率在-1左右,但是对于有些数据无法兼顾到这两点。这两个标准,哪个更重要一点?

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1 个回答

鹅子

1、先认R2

2、就你的数据 计算power值已经到32,数据经过32次幂对应的网络会使得连通性很小,这样得到的网络很难得到hub基因

3、总的而言,对应的数据并不是很适合进行分析,即使分析获得结果可靠性也不高

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  • kuku93 提出于 2018-09-12 16:56

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